More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0345 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  96.42 
 
 
363 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
362 aa  738    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  88.95 
 
 
362 aa  599  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  83.33 
 
 
387 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  83.06 
 
 
395 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  83.89 
 
 
359 aa  568  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  83.47 
 
 
393 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  83.1 
 
 
359 aa  566  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  83.47 
 
 
393 aa  567  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  83.38 
 
 
388 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 
358 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  82.55 
 
 
358 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0389  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 
358 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 
358 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0193  CobW/P47K family protein  82.55 
 
 
358 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3430  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 
358 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2918  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  82.55 
 
 
358 aa  543  1e-153  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0168  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  81.99 
 
 
357 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  72.1 
 
 
363 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  70.17 
 
 
359 aa  473  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  68.23 
 
 
357 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  66.2 
 
 
351 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  67.4 
 
 
362 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  67.96 
 
 
362 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  62.86 
 
 
384 aa  459  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  63.54 
 
 
350 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  64.36 
 
 
343 aa  451  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  64.46 
 
 
359 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  63.74 
 
 
352 aa  444  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  63.16 
 
 
349 aa  437  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  62.15 
 
 
347 aa  436  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  62.5 
 
 
353 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  62.67 
 
 
369 aa  434  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  61.89 
 
 
372 aa  433  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  62.15 
 
 
352 aa  427  1e-118  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  59.67 
 
 
356 aa  427  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  51.39 
 
 
328 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  43.41 
 
 
323 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  42.94 
 
 
325 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  43.25 
 
 
325 aa  289  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  43.21 
 
 
325 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  42.42 
 
 
323 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  42.3 
 
 
325 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.94 
 
 
325 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  42.86 
 
 
334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.28 
 
 
345 aa  272  6e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  40.72 
 
 
350 aa  272  7e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  42.02 
 
 
334 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  41.55 
 
 
353 aa  271  1e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  42.11 
 
 
361 aa  270  4e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  40.06 
 
 
355 aa  269  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  39.61 
 
 
347 aa  266  4e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  39.61 
 
 
350 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  39.5 
 
 
323 aa  264  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  41.27 
 
 
349 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  41.13 
 
 
323 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  38.23 
 
 
316 aa  262  6e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.95 
 
 
319 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.95 
 
 
316 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  38.67 
 
 
320 aa  261  2e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  39.06 
 
 
319 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.95 
 
 
316 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  40.28 
 
 
353 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.95 
 
 
316 aa  261  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.95 
 
 
316 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.95 
 
 
316 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.95 
 
 
316 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  39.06 
 
 
323 aa  259  6e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  38.23 
 
 
316 aa  258  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  38.5 
 
 
319 aa  258  1e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  41.3 
 
 
404 aa  258  2e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  40.85 
 
 
328 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  39.89 
 
 
358 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  39.83 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  37.15 
 
 
326 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  39.61 
 
 
323 aa  252  6e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  41.09 
 
 
328 aa  251  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  41.34 
 
 
320 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  38.61 
 
 
323 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  38.61 
 
 
323 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.74 
 
 
332 aa  249  6e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  40.88 
 
 
322 aa  249  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  40.76 
 
 
364 aa  248  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  40.72 
 
 
343 aa  248  2e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  40.17 
 
 
363 aa  245  9e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  37.12 
 
 
320 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  39.06 
 
 
355 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  38.92 
 
 
394 aa  241  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  38.35 
 
 
317 aa  241  2e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4857  putative GTP-binding protein YjiA  38.76 
 
 
318 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  38.81 
 
 
318 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.715992 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4783  putative GTP-binding protein YjiA  38.81 
 
 
318 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120567  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.73 
 
 
335 aa  238  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4884  putative GTP-binding protein YjiA  38.76 
 
 
318 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.4 
 
 
320 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4936  putative GTP-binding protein YjiA  38.53 
 
 
318 aa  236  6e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.518194  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.71 
 
 
374 aa  236  7e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4878  putative GTP-binding protein YjiA  38.81 
 
 
318 aa  235  8e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4572  putative GTP-binding protein YjiA  38.81 
 
 
318 aa  235  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  40.58 
 
 
367 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>