More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1373 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  91.94 
 
 
374 aa  639    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
393 aa  797    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  85.75 
 
 
343 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  76.86 
 
 
354 aa  553  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  77.3 
 
 
367 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  76.49 
 
 
360 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  75.86 
 
 
369 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  73.51 
 
 
365 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  57.71 
 
 
335 aa  428  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  59.89 
 
 
347 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  58.99 
 
 
349 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  58.6 
 
 
345 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  58.4 
 
 
353 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  57.41 
 
 
350 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  56.88 
 
 
350 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  58.33 
 
 
353 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  56.45 
 
 
320 aa  412  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  58.33 
 
 
355 aa  413  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  58.84 
 
 
355 aa  414  1e-114  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  55.5 
 
 
361 aa  408  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  55.44 
 
 
326 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  58.27 
 
 
358 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  56.06 
 
 
363 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  55.79 
 
 
364 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  52.11 
 
 
329 aa  378  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  52.56 
 
 
320 aa  378  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  51.99 
 
 
328 aa  372  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  51.99 
 
 
328 aa  372  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  52.83 
 
 
320 aa  363  3e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  48.93 
 
 
332 aa  344  1e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  49.73 
 
 
323 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  49.73 
 
 
323 aa  339  5e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  47.27 
 
 
323 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  47.68 
 
 
323 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  47.27 
 
 
323 aa  330  3e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  46.32 
 
 
323 aa  325  7e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  44.5 
 
 
337 aa  299  6e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  41.16 
 
 
404 aa  280  4e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  41.69 
 
 
324 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  41.33 
 
 
394 aa  278  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  59.82 
 
 
493 aa  277  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  44.62 
 
 
375 aa  271  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  42.6 
 
 
384 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  58.18 
 
 
457 aa  270  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  55.91 
 
 
460 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  55.91 
 
 
452 aa  266  5.999999999999999e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  39.13 
 
 
324 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  55.91 
 
 
460 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  55.91 
 
 
460 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  41.49 
 
 
347 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  55.91 
 
 
449 aa  263  3e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  55.45 
 
 
449 aa  264  3e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  55.45 
 
 
449 aa  263  4.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  43.96 
 
 
388 aa  263  6e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  40.16 
 
 
328 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  39.08 
 
 
322 aa  256  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  42.19 
 
 
369 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  42.06 
 
 
360 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  41.71 
 
 
351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  43.54 
 
 
359 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  43.62 
 
 
353 aa  252  6e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  42.02 
 
 
349 aa  250  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  40.58 
 
 
350 aa  247  3e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  41.49 
 
 
352 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  42.63 
 
 
372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  37.08 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  41.76 
 
 
356 aa  243  3e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  44.77 
 
 
369 aa  244  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  39.45 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.47 
 
 
316 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.2 
 
 
316 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.2 
 
 
316 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.2 
 
 
316 aa  236  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  36.66 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.93 
 
 
319 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  36.93 
 
 
316 aa  236  7e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  37.47 
 
 
319 aa  236  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.93 
 
 
316 aa  236  7e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  40.16 
 
 
347 aa  235  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  37.2 
 
 
316 aa  235  9e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.93 
 
 
316 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  40.05 
 
 
357 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  38.59 
 
 
327 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  39.68 
 
 
352 aa  234  3e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  41.13 
 
 
363 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  40.48 
 
 
363 aa  229  4e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  39.18 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  39.22 
 
 
359 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  39.3 
 
 
384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  40.52 
 
 
379 aa  225  1e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  40.21 
 
 
372 aa  224  2e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  41.94 
 
 
362 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  40.66 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  53.46 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  38.66 
 
 
362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  45.53 
 
 
380 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 
373 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 
339 aa  206  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  43.61 
 
 
378 aa  204  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  43.61 
 
 
378 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>