More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2998 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 387 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  94.75 
 
 		 395 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  97.1 
 
 		 393 aa  662    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  97.42 
 
 		 388 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  97.36 
 
 		 393 aa  664    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  95.54 
 
 		 359 aa  624  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  93.91 
 
 		 359 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  85.87 
 
 		 363 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  87.71 
 
 		 358 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0389  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  87.71 
 
 		 358 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3430  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  87.71 
 
 		 358 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  85.99 
 
 		 362 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0193  CobW/P47K family protein  87.71 
 
 		 358 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.294373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  87.71 
 
 		 358 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  87.71 
 
 		 358 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2918  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  87.71 
 
 		 358 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  84.44 
 
 		 362 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0168  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  91.62 
 
 		 357 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  70.99 
 
 		 359 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  65.77 
 
 		 384 aa  471  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  69.83 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  70.19 
 
 		 363 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  66.95 
 
 		 351 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  68.35 
 
 		 357 aa  463  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  64.79 
 
 		 350 aa  463  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  68.16 
 
 		 362 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  65.63 
 
 		 343 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  65.45 
 
 		 359 aa  450  1e-125  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  65.63 
 
 		 352 aa  447  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  65.37 
 
 		 353 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  65.07 
 
 		 352 aa  440  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  62.82 
 
 		 349 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  63.66 
 
 		 347 aa  437  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  64.38 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  61.96 
 
 		 372 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  61.41 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  51.13 
 
 		 328 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  43.1 
 
 		 325 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  42.46 
 
 		 323 aa  288  9e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  42.54 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  42.86 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  43.02 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  42.38 
 
 		 325 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  43.3 
 
 		 334 aa  279  5e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.37 
 
 		 325 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  43.02 
 
 		 334 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  42.43 
 
 		 361 aa  272  8.000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  44.23 
 
 		 353 aa  271  2e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  43.38 
 
 		 355 aa  269  7e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  42.09 
 
 		 323 aa  269  7e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.1 
 
 		 345 aa  268  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  40.85 
 
 		 350 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  41.99 
 
 		 350 aa  265  8e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  39.55 
 
 		 326 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  39.78 
 
 		 323 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  41.69 
 
 		 349 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  39.83 
 
 		 319 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  42.54 
 
 		 347 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  38.7 
 
 		 316 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  41.1 
 
 		 328 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.42 
 
 		 319 aa  261  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.42 
 
 		 316 aa  261  2e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.42 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.42 
 
 		 316 aa  260  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  42.37 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  41.21 
 
 		 320 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.42 
 
 		 316 aa  259  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.42 
 
 		 316 aa  259  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  40.88 
 
 		 404 aa  258  9e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.42 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  39.61 
 
 		 323 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  38.14 
 
 		 316 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  38.42 
 
 		 319 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  38.48 
 
 		 320 aa  256  4e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 		 332 aa  256  7e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  39.04 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  39.04 
 
 		 323 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  38.87 
 
 		 320 aa  252  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  40.9 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  38.72 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  39.56 
 
 		 328 aa  249  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  41.76 
 
 		 320 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  41.13 
 
 		 343 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  39.39 
 
 		 364 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  39.29 
 
 		 394 aa  243  3.9999999999999997e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.91 
 
 		 335 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  41.08 
 
 		 322 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  37.57 
 
 		 329 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  40.57 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  41.67 
 
 		 363 aa  242  7.999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  37.85 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  40.71 
 
 		 355 aa  240  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  37.85 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.31 
 
 		 320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  40.85 
 
 		 354 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.29 
 
 		 374 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  38.68 
 
 		 317 aa  234  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  39.29 
 
 		 388 aa  233  6e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  37.36 
 
 		 323 aa  232  8.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4857  putative GTP-binding protein YjiA  38.84 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>