More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_1001 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 337 aa  677    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  51.38 
 
 		 338 aa  312  3.9999999999999997e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  45.19 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  47.15 
 
 		 364 aa  269  5e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.68 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  45.06 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  42.09 
 
 		 366 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  45.37 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  41.64 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  40.63 
 
 		 408 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  41.19 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.11 
 
 		 390 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.28 
 
 		 386 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  41.67 
 
 		 382 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  41.72 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  40.87 
 
 		 417 aa  239  4e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  43.03 
 
 		 364 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  41.23 
 
 		 420 aa  238  1e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  42.07 
 
 		 390 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  40.82 
 
 		 407 aa  237  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  42.73 
 
 		 331 aa  235  7e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  38.83 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  36.03 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  35.57 
 
 		 394 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  38.24 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  38.24 
 
 		 382 aa  226  6e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  40.47 
 
 		 372 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  41.34 
 
 		 337 aa  224  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  38.23 
 
 		 340 aa  222  9e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  36.8 
 
 		 470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  41.64 
 
 		 375 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  42.65 
 
 		 377 aa  209  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  41.76 
 
 		 367 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  42.22 
 
 		 366 aa  207  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  42.09 
 
 		 366 aa  205  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  38.35 
 
 		 334 aa  199  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  39.52 
 
 		 335 aa  199  6e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  40.85 
 
 		 361 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.34 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.73 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.73 
 
 		 319 aa  193  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.42 
 
 		 316 aa  192  6e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.03 
 
 		 316 aa  192  9e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32.73 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.42 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  32.34 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.42 
 
 		 316 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.73 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.12 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  37.72 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  34.74 
 
 		 328 aa  179  4e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  37.54 
 
 		 327 aa  178  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  33.64 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.74 
 
 		 326 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.94 
 
 		 320 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.44 
 
 		 343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  32.58 
 
 		 354 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.09 
 
 		 404 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.01 
 
 		 360 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.33 
 
 		 394 aa  170  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  32.83 
 
 		 320 aa  169  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.03 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  31.84 
 
 		 353 aa  169  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  33.05 
 
 		 357 aa  169  8e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  32.31 
 
 		 352 aa  169  8e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.13 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.73 
 
 		 324 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.8 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.11 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 		 359 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.82 
 
 		 337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  36.47 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  36.06 
 
 		 325 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.59 
 
 		 325 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  33.92 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.9 
 
 		 350 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  30.56 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  34.63 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  36.39 
 
 		 325 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  31.84 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  31.48 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  35.76 
 
 		 325 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  32.75 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  31.27 
 
 		 346 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  31.07 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  30.92 
 
 		 365 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  35.87 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  35.89 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  31.86 
 
 		 359 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  31.95 
 
 		 350 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  29.62 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  29.89 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  35.24 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  32.17 
 
 		 363 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  31.49 
 
 		 362 aa  159  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>