More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3760 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 326 aa  632  1e-180  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  43.35 
 
 		 328 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  42.19 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.11 
 
 		 386 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.97 
 
 		 390 aa  196  5.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.18 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  39.55 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  38.18 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  36.39 
 
 		 382 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  35.38 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 		 390 aa  186  5e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  38.78 
 
 		 338 aa  186  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  35.84 
 
 		 334 aa  184  1.0000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  35.44 
 
 		 345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  38.39 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  40.37 
 
 		 361 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  36.87 
 
 		 407 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  35.71 
 
 		 419 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  37.83 
 
 		 408 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  34.66 
 
 		 420 aa  177  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  35.24 
 
 		 337 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  36.5 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  40.98 
 
 		 366 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  36.12 
 
 		 372 aa  172  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  38.34 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  34.2 
 
 		 391 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  33.98 
 
 		 395 aa  172  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  35.14 
 
 		 349 aa  172  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  40.98 
 
 		 366 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  36.59 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  40.88 
 
 		 377 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  32.62 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  34.34 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  39.04 
 
 		 367 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  36.8 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  32.21 
 
 		 359 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  36.39 
 
 		 337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  48.15 
 
 		 375 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  30.79 
 
 		 353 aa  157  3e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.6 
 
 		 316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.6 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.92 
 
 		 319 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.6 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.13 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.92 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.6 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  32.53 
 
 		 355 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  31.6 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.6 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  34.29 
 
 		 364 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.27 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  33.62 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.74 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  31.27 
 
 		 352 aa  152  7e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  44.92 
 
 		 362 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  31.62 
 
 		 351 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  30.86 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  32.06 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.42 
 
 		 357 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  35.93 
 
 		 325 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  30.92 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  42.64 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.6 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  41.98 
 
 		 362 aa  149  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  29.53 
 
 		 362 aa  149  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  30.4 
 
 		 352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  45.36 
 
 		 363 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  31.29 
 
 		 394 aa  145  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.28 
 
 		 326 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.99 
 
 		 345 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  34.85 
 
 		 334 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  38.39 
 
 		 387 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  39.09 
 
 		 388 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  34.65 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  30.71 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  38.39 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  38.39 
 
 		 395 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.58 
 
 		 404 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  38.39 
 
 		 393 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.86 
 
 		 325 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  34.95 
 
 		 325 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  31.05 
 
 		 349 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0168  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.16 
 
 		 357 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  37.44 
 
 		 359 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  34.55 
 
 		 334 aa  142  7e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  29.61 
 
 		 359 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  37.91 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  35.38 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.86 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  28.15 
 
 		 384 aa  141  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  30.88 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  31.44 
 
 		 350 aa  140  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  30.09 
 
 		 347 aa  140  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  29.57 
 
 		 362 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3256  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.57 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.162964  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0205  CobW/P47K family protein  40.57 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.57 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338794  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3430  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.57 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2918  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.57 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0872325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>