More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3607 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 394 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  89.34 
 
 		 391 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  68.99 
 
 		 382 aa  513  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  67.26 
 
 		 395 aa  498  1e-140  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  58.16 
 
 		 390 aa  434  1e-120  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  56.82 
 
 		 386 aa  431  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  58.06 
 
 		 382 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  51.3 
 
 		 364 aa  365  1e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  52.97 
 
 		 408 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  49.36 
 
 		 390 aa  350  4e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  50.79 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  52.21 
 
 		 366 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  50.65 
 
 		 375 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  50.65 
 
 		 367 aa  309  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  49.61 
 
 		 377 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  48.23 
 
 		 366 aa  300  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  40.98 
 
 		 350 aa  276  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  39.1 
 
 		 377 aa  258  1e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  38.4 
 
 		 419 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  37.95 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  38.96 
 
 		 340 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  40.32 
 
 		 349 aa  240  4e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  38.54 
 
 		 417 aa  236  4e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  36.07 
 
 		 328 aa  233  6e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  36.94 
 
 		 338 aa  232  7.000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  37.61 
 
 		 372 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  37.6 
 
 		 345 aa  226  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  35.34 
 
 		 420 aa  223  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  36.13 
 
 		 337 aa  221  9.999999999999999e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  36.04 
 
 		 335 aa  219  7e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.81 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  59.32 
 
 		 366 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  37.29 
 
 		 335 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  35.54 
 
 		 366 aa  209  7e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  37.33 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  35.89 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  36.93 
 
 		 363 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.46 
 
 		 350 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  33.07 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  37.4 
 
 		 362 aa  193  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  37.95 
 
 		 350 aa  193  6e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  35.59 
 
 		 351 aa  192  8e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.78 
 
 		 353 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  37.16 
 
 		 349 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.51 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  32.42 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  37.67 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.3 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.71 
 
 		 347 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.3 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.68 
 
 		 319 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.75 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  37.7 
 
 		 362 aa  189  9e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.75 
 
 		 316 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.97 
 
 		 323 aa  189  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.02 
 
 		 316 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  33.8 
 
 		 331 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.86 
 
 		 324 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.97 
 
 		 326 aa  187  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  34.82 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.75 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.97 
 
 		 323 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.75 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.79 
 
 		 353 aa  186  5e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.89 
 
 		 355 aa  186  8e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.81 
 
 		 335 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.64 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  37.75 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.25 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.71 
 
 		 358 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35.87 
 
 		 364 aa  179  9e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 320 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  34.99 
 
 		 350 aa  179  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  33.72 
 
 		 332 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  35.52 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.79 
 
 		 323 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.79 
 
 		 323 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 352 aa  176  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.6 
 
 		 323 aa  176  6e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.43 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  35.18 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.04 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  34.07 
 
 		 352 aa  175  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  44.93 
 
 		 449 aa  172  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 		 339 aa  172  7.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  44.44 
 
 		 452 aa  172  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  36.39 
 
 		 354 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  35.88 
 
 		 359 aa  172  9e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  44.44 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.42 
 
 		 320 aa  172  1e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  33.16 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  43.48 
 
 		 449 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  36.34 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.51 
 
 		 329 aa  166  5e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  44.33 
 
 		 460 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  44.33 
 
 		 460 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  43.96 
 
 		 457 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>