More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1336 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
407 aa  817    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  54.27 
 
 
417 aa  397  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  50.63 
 
 
419 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  51.13 
 
 
420 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  47.61 
 
 
377 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  40.67 
 
 
366 aa  257  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  48.94 
 
 
390 aa  252  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  38.94 
 
 
340 aa  241  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  42.49 
 
 
349 aa  235  8e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  42.25 
 
 
328 aa  235  9e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  38.19 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  40.82 
 
 
337 aa  232  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  41.56 
 
 
408 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 
394 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 
382 aa  231  2e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.63 
 
 
386 aa  230  3e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  41.89 
 
 
345 aa  229  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.22 
 
 
390 aa  229  1e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  41.1 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  44.71 
 
 
364 aa  224  2e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.38 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  43.69 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  39.82 
 
 
387 aa  219  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  38.32 
 
 
395 aa  212  7.999999999999999e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  38.78 
 
 
470 aa  212  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  39.66 
 
 
372 aa  209  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  40.42 
 
 
335 aa  209  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  42.9 
 
 
361 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  41.25 
 
 
334 aa  205  1e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  37.22 
 
 
382 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  42.77 
 
 
366 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  38.53 
 
 
331 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  42.23 
 
 
366 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  38.6 
 
 
328 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  42.38 
 
 
367 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  42.6 
 
 
377 aa  189  9e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  41.14 
 
 
375 aa  186  5e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  35.47 
 
 
337 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  37.35 
 
 
323 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  38.19 
 
 
364 aa  181  2e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  34.38 
 
 
404 aa  180  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  37.5 
 
 
350 aa  180  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.44 
 
 
357 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.15 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.15 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.63 
 
 
323 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 
362 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  36.8 
 
 
347 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  35.34 
 
 
352 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  50 
 
 
362 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  34.87 
 
 
353 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  34.5 
 
 
352 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  34.42 
 
 
394 aa  170  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  35.01 
 
 
359 aa  170  5e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  34.94 
 
 
343 aa  169  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  34.99 
 
 
350 aa  169  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  33.06 
 
 
355 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.01 
 
 
323 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  35.21 
 
 
349 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  33.7 
 
 
387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.94 
 
 
326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  33.7 
 
 
363 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  34.58 
 
 
332 aa  167  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  33.69 
 
 
393 aa  167  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  36.55 
 
 
326 aa  167  4e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 
339 aa  166  8e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  34.62 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  33.42 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.5 
 
 
350 aa  164  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  33.61 
 
 
359 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  32.42 
 
 
384 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  34.02 
 
 
351 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  33.72 
 
 
328 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.62 
 
 
323 aa  163  5.0000000000000005e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  36.64 
 
 
320 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.68 
 
 
361 aa  163  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  45.23 
 
 
362 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  36.34 
 
 
322 aa  162  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.22 
 
 
316 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  34.77 
 
 
356 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32.53 
 
 
316 aa  160  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  47.37 
 
 
363 aa  160  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 
369 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  32.53 
 
 
319 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.53 
 
 
316 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.87 
 
 
319 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.87 
 
 
316 aa  158  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  44.72 
 
 
362 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  35.48 
 
 
323 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  35.26 
 
 
366 aa  158  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.77 
 
 
364 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  43.75 
 
 
395 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.18 
 
 
316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.69 
 
 
325 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.15 
 
 
320 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.18 
 
 
316 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.22 
 
 
320 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  35.17 
 
 
323 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  32.87 
 
 
319 aa  157  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  46.07 
 
 
359 aa  157  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>