More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3932 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  94.33 
 
 		 335 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 335 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  47.77 
 
 		 338 aa  291  9e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  48.05 
 
 		 364 aa  288  6e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  45.81 
 
 		 328 aa  270  2e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  45.27 
 
 		 366 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  45.62 
 
 		 364 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  45.06 
 
 		 337 aa  254  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  43.92 
 
 		 390 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  39.77 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  41.24 
 
 		 408 aa  245  8e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  42.09 
 
 		 387 aa  241  2e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  42.19 
 
 		 337 aa  238  8e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  42.35 
 
 		 345 aa  233  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  39.88 
 
 		 372 aa  229  6e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  36.89 
 
 		 391 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  39.44 
 
 		 382 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  42.56 
 
 		 417 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  37.06 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  39.54 
 
 		 419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.1 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.67 
 
 		 390 aa  223  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  43.69 
 
 		 407 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  39.55 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  39.88 
 
 		 349 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  36.04 
 
 		 394 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  42.63 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  40.12 
 
 		 470 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  44.57 
 
 		 377 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  42.21 
 
 		 375 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  44.08 
 
 		 367 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  37.54 
 
 		 340 aa  209  8e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  40.84 
 
 		 361 aa  207  2e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  42.4 
 
 		 366 aa  206  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  39.94 
 
 		 350 aa  206  5e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  42.69 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  39.52 
 
 		 420 aa  202  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  38.58 
 
 		 334 aa  202  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  40.51 
 
 		 335 aa  198  7.999999999999999e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  39.46 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.62 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.62 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  36.56 
 
 		 323 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  32.77 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.06 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  34.17 
 
 		 316 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  39.87 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  34.48 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.69 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  38.79 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.86 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 316 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  39.27 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.17 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.54 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.86 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.54 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.17 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  37.54 
 
 		 325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  36.28 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 		 323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  38.79 
 
 		 325 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.82 
 
 		 320 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  36.76 
 
 		 328 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.7 
 
 		 320 aa  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.31 
 
 		 325 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.76 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  35.31 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  37.3 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  35.55 
 
 		 366 aa  170  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.74 
 
 		 320 aa  170  4e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.5 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.75 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  34.1 
 
 		 350 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.88 
 
 		 329 aa  165  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.04 
 
 		 335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.14 
 
 		 345 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.17 
 
 		 349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.06 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.86 
 
 		 354 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.92 
 
 		 343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.25 
 
 		 337 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  31.4 
 
 		 350 aa  162  7e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  37.72 
 
 		 334 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.43 
 
 		 394 aa  160  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.86 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  36.53 
 
 		 334 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  33.33 
 
 		 339 aa  159  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  32.2 
 
 		 347 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  33.14 
 
 		 353 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  34.65 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  32.49 
 
 		 358 aa  158  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  32.95 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  37.77 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  31.9 
 
 		 351 aa  155  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  36.7 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.68 
 
 		 353 aa  154  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>