More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0557 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 470 aa  926    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  50.9 
 
 		 364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  44.35 
 
 		 387 aa  276  8e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  43.5 
 
 		 366 aa  275  9e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  43.75 
 
 		 390 aa  273  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.8 
 
 		 390 aa  272  8.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.25 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  43.13 
 
 		 382 aa  268  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  42.31 
 
 		 408 aa  259  7e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  36.86 
 
 		 391 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  40.76 
 
 		 419 aa  252  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  49.55 
 
 		 377 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  41.29 
 
 		 377 aa  251  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  38.23 
 
 		 394 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  40.95 
 
 		 382 aa  244  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  48.19 
 
 		 366 aa  243  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  48.49 
 
 		 366 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  43.3 
 
 		 372 aa  241  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  48.8 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  47.88 
 
 		 367 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  42.3 
 
 		 361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  42.48 
 
 		 345 aa  228  1e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  41.69 
 
 		 328 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  38.79 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  40.53 
 
 		 417 aa  223  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  39.15 
 
 		 349 aa  222  9.999999999999999e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.7 
 
 		 335 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  40.91 
 
 		 335 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  40.48 
 
 		 338 aa  217  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  37.43 
 
 		 420 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  37.61 
 
 		 337 aa  216  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  36.9 
 
 		 340 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  39.53 
 
 		 407 aa  213  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  40.18 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  38.94 
 
 		 337 aa  206  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  37.13 
 
 		 366 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  35.67 
 
 		 350 aa  202  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  39.94 
 
 		 335 aa  201  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  38.17 
 
 		 364 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 328 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  37.13 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  37.13 
 
 		 331 aa  190  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.5 
 
 		 332 aa  190  5.999999999999999e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.43 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.73 
 
 		 316 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.43 
 
 		 316 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.56 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.36 
 
 		 353 aa  180  5.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.13 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32.43 
 
 		 316 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.39 
 
 		 355 aa  179  7e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.13 
 
 		 316 aa  179  9e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  35.24 
 
 		 320 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.83 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.83 
 
 		 319 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  32.43 
 
 		 319 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35 
 
 		 323 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.83 
 
 		 316 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.51 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.38 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  32.44 
 
 		 319 aa  177  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 335 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.28 
 
 		 347 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.8 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.81 
 
 		 345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  33.82 
 
 		 323 aa  173  5e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.36 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  32.15 
 
 		 353 aa  172  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 323 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  32.85 
 
 		 323 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 349 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  32.33 
 
 		 363 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  33.92 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.31 
 
 		 323 aa  170  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  32.1 
 
 		 350 aa  170  5e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  33.91 
 
 		 363 aa  170  5e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.51 
 
 		 323 aa  170  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  33.61 
 
 		 362 aa  169  9e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.61 
 
 		 322 aa  169  1e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  36.53 
 
 		 329 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.03 
 
 		 320 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  32.59 
 
 		 352 aa  168  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.77 
 
 		 360 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 		 360 aa  167  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  31.12 
 
 		 404 aa  167  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  32.45 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  46.99 
 
 		 362 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.34 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.34 
 
 		 328 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  33.87 
 
 		 354 aa  164  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  31.95 
 
 		 355 aa  164  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  42.11 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  35.03 
 
 		 343 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  45.9 
 
 		 359 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 		 358 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 		 329 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  34.21 
 
 		 320 aa  161  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  32.87 
 
 		 363 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>