More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2305 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 329 aa  665    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  41.85 
 
 		 323 aa  261  8e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  43.32 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  40.12 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  41.49 
 
 		 335 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  39.64 
 
 		 350 aa  252  5.000000000000001e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  41.54 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.95 
 
 		 374 aa  249  6e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  40.87 
 
 		 328 aa  248  7e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  40.87 
 
 		 328 aa  248  7e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  40.56 
 
 		 329 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  39.71 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  41.54 
 
 		 326 aa  245  6e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  38.51 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  39.71 
 
 		 350 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  38.14 
 
 		 354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  39.76 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  39.19 
 
 		 353 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  39.76 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  41.74 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  39.08 
 
 		 349 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  37.61 
 
 		 358 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  41.8 
 
 		 332 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  39.75 
 
 		 323 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  37.24 
 
 		 347 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  39.45 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  40.62 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.94 
 
 		 345 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  40.62 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  38.59 
 
 		 360 aa  236  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  40.12 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.79 
 
 		 355 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  39.63 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  37.4 
 
 		 367 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  37.82 
 
 		 364 aa  231  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  36.47 
 
 		 363 aa  229  4e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.93 
 
 		 355 aa  228  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  37.29 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  38.58 
 
 		 394 aa  226  4e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  36.99 
 
 		 353 aa  226  6e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  36.16 
 
 		 375 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  39.14 
 
 		 337 aa  223  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  37.83 
 
 		 360 aa  222  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  38.65 
 
 		 324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  36.73 
 
 		 319 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35.26 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.11 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 		 316 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.11 
 
 		 316 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.11 
 
 		 319 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.11 
 
 		 316 aa  215  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  51.53 
 
 		 452 aa  215  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.42 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  36.11 
 
 		 319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.11 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.42 
 
 		 316 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  51.79 
 
 		 460 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  51.28 
 
 		 449 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  36.81 
 
 		 369 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  51.28 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  36.36 
 
 		 404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  51.28 
 
 		 449 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  52.04 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  36.11 
 
 		 316 aa  212  5.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  51.28 
 
 		 460 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  51.28 
 
 		 460 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  36.04 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 352 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  35.57 
 
 		 353 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  49.75 
 
 		 369 aa  202  8e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  47.6 
 
 		 493 aa  200  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  34.86 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  35.34 
 
 		 349 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 		 343 aa  191  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  35.51 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  34.73 
 
 		 359 aa  191  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  35.53 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  36.76 
 
 		 349 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.51 
 
 		 357 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  35.65 
 
 		 347 aa  188  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  35.09 
 
 		 327 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  35.06 
 
 		 350 aa  186  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  34.6 
 
 		 384 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  35.14 
 
 		 352 aa  186  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  36.28 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  40.37 
 
 		 325 aa  186  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  37.07 
 
 		 366 aa  185  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  35.51 
 
 		 328 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  39.14 
 
 		 325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  33.88 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  39.7 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  39.75 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04218  predicted GTPase  34.36 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  37.8 
 
 		 345 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4892  putative GTP-binding protein YjiA  34.36 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4944  putative GTP-binding protein YjiA  34.36 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  34.55 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04184  hypothetical protein  34.36 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3714  putative GTP-binding protein YjiA  34.36 
 
 		 318 aa  181  2e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>