More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5092 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 327 aa  660    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  46.89 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  47.78 
 
 		 323 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  45.89 
 
 		 323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  44.94 
 
 		 323 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  43.89 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  43.89 
 
 		 323 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  45.25 
 
 		 323 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  45.45 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  46.86 
 
 		 335 aa  281  8.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  49.37 
 
 		 322 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  41.72 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  44.51 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  44.1 
 
 		 326 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  44.54 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  44.62 
 
 		 320 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  45.06 
 
 		 328 aa  265  7e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  40.68 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  43.4 
 
 		 349 aa  262  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  42.94 
 
 		 353 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  40.91 
 
 		 355 aa  260  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  40.68 
 
 		 358 aa  260  2e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  42.48 
 
 		 350 aa  259  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  42.6 
 
 		 343 aa  259  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  40.37 
 
 		 404 aa  259  4e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  40.57 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  44.94 
 
 		 320 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  45.11 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  45.11 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  44.65 
 
 		 332 aa  258  9e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  44.79 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  40.8 
 
 		 360 aa  256  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  41.21 
 
 		 361 aa  255  8e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  42.4 
 
 		 350 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  40.28 
 
 		 364 aa  253  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  41.5 
 
 		 355 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.06 
 
 		 345 aa  253  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 		 367 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.67 
 
 		 374 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  43.4 
 
 		 347 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  39.22 
 
 		 365 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  39.11 
 
 		 369 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  36.88 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.56 
 
 		 316 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  39.37 
 
 		 354 aa  240  2e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  36.25 
 
 		 319 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.56 
 
 		 316 aa  238  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.25 
 
 		 319 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  35.94 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.25 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.56 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.94 
 
 		 316 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.62 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  40.38 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  40.38 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  42.69 
 
 		 360 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  42.06 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  41.21 
 
 		 375 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  41.01 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  39.7 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  35.73 
 
 		 350 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  40.92 
 
 		 369 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  40.13 
 
 		 323 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.65 
 
 		 325 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  39.62 
 
 		 325 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  34.06 
 
 		 384 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  35.43 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  35.07 
 
 		 349 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  35.45 
 
 		 351 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  35.24 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  40.44 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 		 343 aa  216  2.9999999999999998e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  35.06 
 
 		 352 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  40.13 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  37.16 
 
 		 339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.82 
 
 		 360 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.34 
 
 		 356 aa  212  5.999999999999999e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  36.28 
 
 		 346 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  34.08 
 
 		 359 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  34.72 
 
 		 388 aa  207  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  35.86 
 
 		 347 aa  206  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  32.6 
 
 		 369 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  37.93 
 
 		 323 aa  203  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  32.96 
 
 		 363 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  32.58 
 
 		 362 aa  202  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  32.39 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  32.78 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  32.39 
 
 		 359 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  32.77 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  32.77 
 
 		 393 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.84 
 
 		 357 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  32.03 
 
 		 395 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  32.68 
 
 		 388 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  34.32 
 
 		 339 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  34.92 
 
 		 362 aa  199  6e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  32.49 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  34.93 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  48.86 
 
 		 393 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  33.98 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>