More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1611 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 366 aa  730    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.75 
 
 		 390 aa  326  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  51.13 
 
 		 387 aa  325  5e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.22 
 
 		 386 aa  326  5e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  51.09 
 
 		 390 aa  323  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  50.14 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  49.86 
 
 		 408 aa  319  5e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  45.35 
 
 		 419 aa  315  9e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  50.55 
 
 		 364 aa  315  9e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  45.98 
 
 		 377 aa  311  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  48.23 
 
 		 394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 		 382 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  47.24 
 
 		 395 aa  287  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  44.19 
 
 		 349 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  42.9 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  47.15 
 
 		 382 aa  281  8.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  53.35 
 
 		 367 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  42.66 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  43.79 
 
 		 470 aa  270  2e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  52.92 
 
 		 377 aa  270  4e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.69 
 
 		 335 aa  265  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  45.4 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  41.23 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  50.56 
 
 		 366 aa  260  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  41.93 
 
 		 338 aa  259  4e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  50.84 
 
 		 366 aa  259  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  41.67 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  42.42 
 
 		 345 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  40.68 
 
 		 337 aa  252  6e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  48.89 
 
 		 375 aa  251  1e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  40.4 
 
 		 331 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  37.95 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  41.97 
 
 		 372 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  39.83 
 
 		 364 aa  226  5.0000000000000005e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  39.83 
 
 		 334 aa  225  9e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  41.41 
 
 		 361 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 		 337 aa  219  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  39.43 
 
 		 335 aa  218  1e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  38.53 
 
 		 332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  38.55 
 
 		 328 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  39.44 
 
 		 366 aa  211  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  38.16 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  37.86 
 
 		 320 aa  209  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  36.26 
 
 		 323 aa  206  5e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.55 
 
 		 319 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  35.84 
 
 		 316 aa  206  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.55 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.55 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.97 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  36.13 
 
 		 319 aa  206  7e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  38.44 
 
 		 388 aa  206  8e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.55 
 
 		 316 aa  205  8e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  35.26 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.55 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.26 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  34.97 
 
 		 316 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  38.4 
 
 		 350 aa  202  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.52 
 
 		 320 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  37.96 
 
 		 351 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  38.86 
 
 		 359 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  35.52 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 323 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  37.91 
 
 		 363 aa  199  6e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  37.54 
 
 		 350 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.04 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 		 323 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  37.7 
 
 		 364 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  38.07 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  35.36 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  37.4 
 
 		 353 aa  194  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  37.92 
 
 		 322 aa  193  5e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.52 
 
 		 360 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  39.94 
 
 		 352 aa  192  8e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  41.16 
 
 		 349 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  39.34 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  36.29 
 
 		 324 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  38.68 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  40.41 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  37.22 
 
 		 362 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.98 
 
 		 323 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.03 
 
 		 326 aa  189  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  37.67 
 
 		 359 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.75 
 
 		 343 aa  189  7e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.52 
 
 		 320 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.68 
 
 		 355 aa  189  9e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  37.54 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  37.88 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  31.2 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  38.5 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  38.5 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  39.08 
 
 		 353 aa  186  4e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  39.45 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.7 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  36.11 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.38 
 
 		 347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  36.97 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  38.1 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.46 
 
 		 356 aa  182  1e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.69 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>