More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1219 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 366 aa  717    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  97.54 
 
 		 366 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  89.6 
 
 		 375 aa  565  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  79.01 
 
 		 364 aa  525  1e-148  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  78.98 
 
 		 377 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  78.69 
 
 		 367 aa  480  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  59.68 
 
 		 408 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  58.47 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  54.78 
 
 		 390 aa  393  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  55.09 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  57.45 
 
 		 387 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  55.05 
 
 		 382 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  52.07 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  51.44 
 
 		 391 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  52.74 
 
 		 395 aa  360  2e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  54.79 
 
 		 382 aa  359  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  50.56 
 
 		 366 aa  301  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  45.96 
 
 		 350 aa  286  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  48.49 
 
 		 470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  46.33 
 
 		 338 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  45.35 
 
 		 366 aa  265  8.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  43.92 
 
 		 377 aa  263  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  43.55 
 
 		 419 aa  262  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  44.69 
 
 		 417 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  43.8 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  43.17 
 
 		 372 aa  245  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  44.08 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.11 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  45.57 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  41.81 
 
 		 335 aa  235  9e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  43.98 
 
 		 345 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  43.54 
 
 		 337 aa  232  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  44.55 
 
 		 361 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  39.73 
 
 		 420 aa  230  2e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  43.9 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  41.32 
 
 		 340 aa  226  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  43.37 
 
 		 407 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  42.01 
 
 		 337 aa  216  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  41.76 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  39.94 
 
 		 364 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  37.8 
 
 		 328 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  38.12 
 
 		 335 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  38.32 
 
 		 320 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 		 364 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  39.76 
 
 		 343 aa  182  6e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  37.35 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  39.07 
 
 		 350 aa  180  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  35.19 
 
 		 350 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  35.69 
 
 		 320 aa  178  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  36.39 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  39.47 
 
 		 350 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  36.05 
 
 		 353 aa  176  8e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  38.3 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  38.3 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.2 
 
 		 355 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.21 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  37.71 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  37.01 
 
 		 354 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.33 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  37.69 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.64 
 
 		 347 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  36.18 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  35.54 
 
 		 367 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  34.56 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.57 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  39.88 
 
 		 349 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  34.68 
 
 		 353 aa  171  3e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  35.11 
 
 		 355 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  36.23 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3760  cobalamin synthesis protein, P47K  40.79 
 
 		 326 aa  170  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.89 
 
 		 394 aa  169  5e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  36.86 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.34 
 
 		 323 aa  169  9e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  36.28 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  37.64 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.94 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  35.8 
 
 		 351 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.94 
 
 		 323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.93 
 
 		 374 aa  166  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  37.21 
 
 		 324 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  34.97 
 
 		 365 aa  166  9e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.83 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  33.03 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.83 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.83 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  47.49 
 
 		 359 aa  164  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.42 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 349 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.03 
 
 		 316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.42 
 
 		 319 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  36.92 
 
 		 322 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  34.31 
 
 		 359 aa  163  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  35.63 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.23 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 339 aa  161  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  46.93 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  33.72 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>