More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0359 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 387 aa  776    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1368  cobalamin synthesis protein P47K  70.31 
 
 		 408 aa  498  1e-140  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.389271 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  57.81 
 
 		 364 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  57.85 
 
 		 390 aa  404  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  56.57 
 
 		 382 aa  385  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2035  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.49 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  53.32 
 
 		 386 aa  380  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  52.67 
 
 		 382 aa  363  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1219  cobalamin synthesis protein P47K  57.03 
 
 		 366 aa  361  1e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.338424 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1380  cobalamin synthesis protein P47K  56.65 
 
 		 366 aa  360  3e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0678447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1159  cobalamin synthesis protein P47K  56.99 
 
 		 375 aa  359  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  49.74 
 
 		 394 aa  358  6e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  49.61 
 
 		 391 aa  355  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5439  cobalamin synthesis protein P47K  56.69 
 
 		 367 aa  355  8.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  56.51 
 
 		 377 aa  345  7e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  49.34 
 
 		 395 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  51.39 
 
 		 366 aa  333  3e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2534  cobW protein  47.13 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.132259  normal  0.646517 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  45.01 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  41.84 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  43.09 
 
 		 417 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  42.82 
 
 		 377 aa  269  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  46.53 
 
 		 337 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  43.7 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  44.81 
 
 		 328 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  43.32 
 
 		 372 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.52 
 
 		 335 aa  246  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  42.82 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  40.47 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3058  cobalamin synthesis protein, P47K  40.43 
 
 		 350 aa  244  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  42.82 
 
 		 361 aa  242  7e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1331  cobalamin synthesis protein, P47K  40.75 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  38.48 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  43.66 
 
 		 345 aa  236  7e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1336  cobalamin synthesis protein P47K  41.62 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  41.28 
 
 		 335 aa  231  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3179  cobalamin synthesis protein, P47K  40.73 
 
 		 334 aa  218  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.250696  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  37.27 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  40.47 
 
 		 337 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  38.33 
 
 		 331 aa  210  3e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  38.73 
 
 		 328 aa  209  7e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  40.23 
 
 		 362 aa  195  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  40.23 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  39.89 
 
 		 359 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  37.54 
 
 		 363 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.1 
 
 		 355 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.09 
 
 		 343 aa  192  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.43 
 
 		 345 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  34.96 
 
 		 332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  37.78 
 
 		 362 aa  189  5e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  33.15 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  34.74 
 
 		 384 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.48 
 
 		 320 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  36.83 
 
 		 359 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.47 
 
 		 316 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.18 
 
 		 316 aa  186  7e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  35.63 
 
 		 350 aa  186  7e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.18 
 
 		 316 aa  186  7e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 319 aa  186  7e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  30.88 
 
 		 316 aa  186  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.18 
 
 		 316 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.73 
 
 		 326 aa  185  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.88 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  31.18 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.86 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.44 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.88 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  32.87 
 
 		 394 aa  185  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.59 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  34.81 
 
 		 339 aa  184  3e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  36.75 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  35.8 
 
 		 359 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.81 
 
 		 335 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  35.49 
 
 		 350 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.88 
 
 		 319 aa  183  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  36.16 
 
 		 393 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.9 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  35.99 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  35.61 
 
 		 388 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  35.96 
 
 		 353 aa  181  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  35.88 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.85 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  36.44 
 
 		 363 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 320 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.39 
 
 		 349 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  36.69 
 
 		 353 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.29 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.91 
 
 		 347 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.02 
 
 		 320 aa  179  8e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  34.72 
 
 		 362 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.24 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  33.62 
 
 		 355 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  35.69 
 
 		 351 aa  178  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  37.01 
 
 		 352 aa  176  5e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.63 
 
 		 323 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  35.68 
 
 		 388 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  33.05 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  38.2 
 
 		 334 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 		 328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>