More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3717 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 379 aa  779    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  75.26 
 
 		 362 aa  557  1e-157  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  72.82 
 
 		 373 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  72.03 
 
 		 378 aa  538  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  71.77 
 
 		 378 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  71.65 
 
 		 380 aa  530  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  67.96 
 
 		 384 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  68.83 
 
 		 382 aa  471  1e-132  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  61.38 
 
 		 379 aa  444  1e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  61.68 
 
 		 372 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  56.76 
 
 		 366 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  56.27 
 
 		 349 aa  402  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  57.34 
 
 		 362 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  54.97 
 
 		 362 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  56.55 
 
 		 357 aa  382  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  56.13 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  54.77 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  55.37 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  54.22 
 
 		 353 aa  369  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  51.1 
 
 		 342 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  51.37 
 
 		 344 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  49.18 
 
 		 327 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  51.65 
 
 		 341 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  49.31 
 
 		 338 aa  333  2e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  64.04 
 
 		 383 aa  273  3e-72  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  38.96 
 
 		 343 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  38.65 
 
 		 355 aa  226  6e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  37.73 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.99 
 
 		 360 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  38.48 
 
 		 349 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.22 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  37.74 
 
 		 350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  37.7 
 
 		 320 aa  219  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  39.46 
 
 		 360 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  36.54 
 
 		 367 aa  219  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  39.79 
 
 		 393 aa  219  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  35.37 
 
 		 364 aa  219  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  38.13 
 
 		 354 aa  219  7.999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  37.67 
 
 		 353 aa  218  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  39.3 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.94 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.21 
 
 		 345 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.07 
 
 		 332 aa  216  4e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  38.98 
 
 		 369 aa  215  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.13 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.9 
 
 		 326 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  36.12 
 
 		 362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.19 
 
 		 328 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.19 
 
 		 328 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.73 
 
 		 329 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  36.78 
 
 		 323 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  38.48 
 
 		 353 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.6 
 
 		 335 aa  211  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  35.42 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.5 
 
 		 358 aa  209  8e-53  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  38.01 
 
 		 365 aa  209  8e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.42 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.96 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.96 
 
 		 323 aa  206  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  36.57 
 
 		 388 aa  206  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.07 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  38.44 
 
 		 363 aa  205  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  49.01 
 
 		 457 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  48.51 
 
 		 460 aa  204  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  36.64 
 
 		 364 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  37.08 
 
 		 336 aa  203  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  48.5 
 
 		 460 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  47.29 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  37.37 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  48.5 
 
 		 493 aa  201  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.5 
 
 		 388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.15 
 
 		 323 aa  200  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  47.29 
 
 		 449 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  48 
 
 		 452 aa  199  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.15 
 
 		 324 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  46.8 
 
 		 449 aa  197  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  47 
 
 		 449 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  30.7 
 
 		 423 aa  195  1e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  30.47 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.79 
 
 		 417 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  31.74 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.7 
 
 		 375 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.61 
 
 		 324 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  30.95 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  33.79 
 
 		 349 aa  187  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  30.17 
 
 		 401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  36.39 
 
 		 353 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 		 405 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2135  cobalamin synthesis protein P47K  31.34 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  29.29 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  35.04 
 
 		 362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  29.62 
 
 		 406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.6 
 
 		 322 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  30.62 
 
 		 408 aa  182  9.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  30.02 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  29.38 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.58 
 
 		 357 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  35.31 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  29.79 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>