More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0441 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
382 aa  775    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  69.21 
 
 
373 aa  491  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  67.98 
 
 
378 aa  487  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  67.72 
 
 
378 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  71.27 
 
 
379 aa  476  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  63.95 
 
 
384 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  65.23 
 
 
380 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  64.13 
 
 
362 aa  452  1.0000000000000001e-126  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  56.18 
 
 
379 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  56.18 
 
 
372 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  56.08 
 
 
349 aa  394  1e-108  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  54.91 
 
 
366 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  53.33 
 
 
357 aa  364  1e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  53.1 
 
 
346 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  51.36 
 
 
362 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  51.65 
 
 
342 aa  359  5e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  51.92 
 
 
362 aa  358  9e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  52.29 
 
 
346 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  50.55 
 
 
344 aa  355  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  51.44 
 
 
353 aa  355  7.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  52.17 
 
 
349 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  49.32 
 
 
341 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  46.74 
 
 
327 aa  335  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  47.84 
 
 
338 aa  308  8e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  59.51 
 
 
383 aa  258  9e-68  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.62 
 
 
345 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  38.73 
 
 
350 aa  229  8e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  39.36 
 
 
349 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  38.07 
 
 
350 aa  227  2e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  38.64 
 
 
361 aa  227  3e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.78 
 
 
326 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  39.67 
 
 
354 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 
355 aa  218  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.77 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  37.74 
 
 
355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  38.92 
 
 
353 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  38.21 
 
 
360 aa  216  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  38.21 
 
 
353 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  38.75 
 
 
347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.04 
 
 
323 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.22 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.47 
 
 
360 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  35.87 
 
 
343 aa  210  3e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  38.32 
 
 
365 aa  209  5e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.78 
 
 
323 aa  208  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.83 
 
 
388 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 
320 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.05 
 
 
323 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.05 
 
 
323 aa  207  4e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  48.57 
 
 
369 aa  206  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  33.77 
 
 
335 aa  206  7e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  31.52 
 
 
401 aa  206  8e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  45.71 
 
 
460 aa  206  8e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  47.8 
 
 
460 aa  205  1e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  37.67 
 
 
358 aa  205  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  47.8 
 
 
460 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 
364 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.95 
 
 
329 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  47.55 
 
 
457 aa  203  4e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.5 
 
 
374 aa  202  7e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.96 
 
 
328 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.96 
 
 
328 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.15 
 
 
323 aa  200  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.15 
 
 
324 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  34.99 
 
 
320 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  31.43 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.07 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  32.06 
 
 
403 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 
363 aa  199  7e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  36.1 
 
 
388 aa  199  7.999999999999999e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  37.9 
 
 
393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  46.15 
 
 
449 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  47.03 
 
 
449 aa  197  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 
320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  46.34 
 
 
449 aa  197  3e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  46.15 
 
 
367 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 
408 aa  196  6e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  46.34 
 
 
452 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  29.12 
 
 
406 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  28.88 
 
 
406 aa  196  7e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  36.91 
 
 
364 aa  195  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2487  putative 47 kDa protein  29.86 
 
 
401 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  28.64 
 
 
405 aa  194  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  30.22 
 
 
403 aa  192  6e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  28.71 
 
 
406 aa  192  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  30.14 
 
 
400 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  35.45 
 
 
375 aa  191  2e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2995  cobalamin synthesis protein P47K  30.64 
 
 
410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  29.15 
 
 
406 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  30.79 
 
 
404 aa  190  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  32.66 
 
 
336 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  29.76 
 
 
402 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.78 
 
 
394 aa  189  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1647  cobalamin synthesis protein P47K  31.26 
 
 
402 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6215  cobalamin synthesis protein P47K  29.52 
 
 
407 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.103879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  29.5 
 
 
407 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  36.02 
 
 
384 aa  188  1e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.33 
 
 
402 aa  188  2e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  29.56 
 
 
373 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>