More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_05171 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  100 
 
 
362 aa  731    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  93.09 
 
 
362 aa  597  1e-169  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  87.99 
 
 
383 aa  580  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  83.15 
 
 
357 aa  529  1e-149  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  58.4 
 
 
379 aa  427  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  58.13 
 
 
372 aa  425  1e-118  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  58.19 
 
 
380 aa  405  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  58.24 
 
 
366 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  55.68 
 
 
349 aa  399  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  56.39 
 
 
384 aa  398  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  57.73 
 
 
379 aa  387  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  54.78 
 
 
378 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  56.46 
 
 
362 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  54.49 
 
 
378 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  55.06 
 
 
373 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  55.46 
 
 
344 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  55.34 
 
 
342 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  53.69 
 
 
338 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  51.51 
 
 
382 aa  352  5e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  47.06 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  47.06 
 
 
349 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  47.06 
 
 
346 aa  312  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  45.66 
 
 
353 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  43.98 
 
 
327 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  41.16 
 
 
341 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  34.81 
 
 
332 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  35.81 
 
 
353 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.54 
 
 
343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.46 
 
 
355 aa  212  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.35 
 
 
335 aa  210  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  33.88 
 
 
323 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  33.97 
 
 
354 aa  210  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 
323 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 
323 aa  209  5e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.15 
 
 
360 aa  209  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  32.87 
 
 
320 aa  209  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.1 
 
 
349 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.51 
 
 
360 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  36.78 
 
 
369 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.98 
 
 
320 aa  206  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  34.35 
 
 
355 aa  206  7e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  33.33 
 
 
350 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  34.99 
 
 
353 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  33.88 
 
 
361 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.07 
 
 
345 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  34.62 
 
 
358 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  33.8 
 
 
350 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  35.03 
 
 
365 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 
320 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  36.07 
 
 
367 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  34.62 
 
 
347 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.78 
 
 
323 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
329 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.4 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.5 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.07 
 
 
326 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  32.23 
 
 
324 aa  200  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.46 
 
 
363 aa  199  9e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  32.87 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  32.87 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.79 
 
 
374 aa  197  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  34.56 
 
 
364 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  33.69 
 
 
393 aa  192  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  43.69 
 
 
460 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  43.5 
 
 
460 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  44.39 
 
 
493 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  31.32 
 
 
324 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  30.31 
 
 
402 aa  189  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  34.73 
 
 
362 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  33.15 
 
 
322 aa  189  8e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  42.5 
 
 
460 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  31.37 
 
 
375 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  42.08 
 
 
449 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  42.08 
 
 
449 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  42.71 
 
 
452 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  35.01 
 
 
369 aa  186  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  42.21 
 
 
449 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  42.5 
 
 
457 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 
336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  43.78 
 
 
364 aa  183  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  29.06 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  29.06 
 
 
400 aa  183  4.0000000000000006e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  29.36 
 
 
337 aa  182  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  29.2 
 
 
408 aa  182  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  33.6 
 
 
404 aa  182  7e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  27.12 
 
 
400 aa  181  2e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  28.83 
 
 
376 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  29.26 
 
 
406 aa  180  4e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  29.85 
 
 
373 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  28.81 
 
 
424 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 
349 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  32.03 
 
 
329 aa  176  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  27.95 
 
 
420 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  29.49 
 
 
417 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  28.16 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  29.19 
 
 
400 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  28.61 
 
 
388 aa  173  5e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  27.99 
 
 
406 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  29.61 
 
 
408 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  30.79 
 
 
339 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>