More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0321 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
364 aa  739    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  60.71 
 
 
362 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  60.71 
 
 
369 aa  413  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  51.32 
 
 
336 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  46.92 
 
 
349 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  39.07 
 
 
384 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  39.88 
 
 
341 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  36.72 
 
 
349 aa  232  9e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  35.75 
 
 
379 aa  227  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  35.75 
 
 
372 aa  228  2e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  38.42 
 
 
362 aa  227  3e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  35.56 
 
 
380 aa  226  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  38.44 
 
 
353 aa  225  9e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  39.49 
 
 
366 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  37.88 
 
 
327 aa  225  1e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  38.46 
 
 
346 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  36.69 
 
 
378 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  36.69 
 
 
378 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  39.64 
 
 
346 aa  218  1e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 
373 aa  216  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  36.13 
 
 
344 aa  215  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  35.86 
 
 
342 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.47 
 
 
360 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  36.31 
 
 
349 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  34.38 
 
 
357 aa  204  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  37.61 
 
 
323 aa  204  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  34.81 
 
 
347 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  37.39 
 
 
323 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  37.39 
 
 
323 aa  200  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  36.83 
 
 
324 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  38.89 
 
 
324 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  36.28 
 
 
323 aa  192  8e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  37.65 
 
 
326 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.69 
 
 
332 aa  190  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 
406 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 
376 aa  189  8e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  35.06 
 
 
320 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.26 
 
 
360 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  44.71 
 
 
379 aa  187  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  35.22 
 
 
343 aa  187  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  34.93 
 
 
338 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  44.28 
 
 
362 aa  186  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  35.36 
 
 
354 aa  186  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 
375 aa  186  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 
364 aa  185  9e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  32.11 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  43.78 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  44.28 
 
 
383 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 
319 aa  181  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  42.23 
 
 
457 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.46 
 
 
320 aa  182  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  34.28 
 
 
406 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.84 
 
 
323 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 
358 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  42.35 
 
 
449 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.45 
 
 
335 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  42.05 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 
402 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.13 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  42.35 
 
 
449 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  43.52 
 
 
449 aa  179  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  34.09 
 
 
353 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35.31 
 
 
346 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.17 
 
 
347 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  41.75 
 
 
460 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  33.91 
 
 
400 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  41.84 
 
 
452 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  41.84 
 
 
460 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.77 
 
 
323 aa  177  2e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.17 
 
 
322 aa  177  2e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  33.05 
 
 
373 aa  178  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.22 
 
 
320 aa  177  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  33.14 
 
 
355 aa  176  4e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.55 
 
 
337 aa  176  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.83 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  32.13 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  42.2 
 
 
369 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  31.64 
 
 
319 aa  176  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.41 
 
 
350 aa  176  7e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  36.7 
 
 
329 aa  176  7e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.48 
 
 
345 aa  176  7e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.53 
 
 
316 aa  176  8e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  34.13 
 
 
399 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.34 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  35.17 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.53 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  33.25 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.04 
 
 
394 aa  175  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.78 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.83 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.83 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.78 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  40.81 
 
 
365 aa  173  3.9999999999999995e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  33.07 
 
 
422 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  34.39 
 
 
349 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  41.33 
 
 
367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.76 
 
 
349 aa  173  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  43.81 
 
 
493 aa  172  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.53 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.43 
 
 
353 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>