More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3846 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 341 aa  699    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  64.93 
 
 		 349 aa  443  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  65.78 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  63.44 
 
 		 346 aa  408  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  63.75 
 
 		 346 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  58.88 
 
 		 327 aa  397  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  51.83 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  52.86 
 
 		 378 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  51.2 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  52.86 
 
 		 378 aa  358  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  53.78 
 
 		 373 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  54.95 
 
 		 362 aa  353  4e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  50.9 
 
 		 366 aa  322  6e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  45.3 
 
 		 379 aa  321  9.000000000000001e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  45.03 
 
 		 372 aa  320  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  48.41 
 
 		 349 aa  319  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  45.67 
 
 		 344 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  45.59 
 
 		 342 aa  295  7e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  42.69 
 
 		 357 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  40.33 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  63.73 
 
 		 379 aa  265  8e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  44.38 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  58.74 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  39.88 
 
 		 364 aa  239  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  40.31 
 
 		 323 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  37.54 
 
 		 336 aa  224  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  39.08 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  38.65 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  38.65 
 
 		 323 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  39.08 
 
 		 323 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  38.15 
 
 		 323 aa  216  5.9999999999999996e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  37.86 
 
 		 362 aa  215  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  49.29 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  37.5 
 
 		 360 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  48.31 
 
 		 362 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.44 
 
 		 349 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  37 
 
 		 349 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  37.92 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  34.99 
 
 		 350 aa  207  3e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.76 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  34.82 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.04 
 
 		 361 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  34.6 
 
 		 388 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  34.29 
 
 		 406 aa  200  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  34.71 
 
 		 347 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.19 
 
 		 345 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.9 
 
 		 335 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  33.42 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  35.07 
 
 		 369 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3630  cobalamin synthesis protein P47K  32.9 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.31 
 
 		 337 aa  196  3e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  32.73 
 
 		 407 aa  195  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  33.42 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  32.05 
 
 		 410 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  33.07 
 
 		 406 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.81 
 
 		 353 aa  193  5e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  36.47 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  32.8 
 
 		 417 aa  192  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.84 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1091  cobalamin synthesis protein P47K  31.46 
 
 		 406 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22980  Cobalamin synthesis protein  33.51 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  35.71 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  35.71 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  32.31 
 
 		 406 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 355 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.06 
 
 		 316 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  34.04 
 
 		 408 aa  189  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.55 
 
 		 343 aa  188  9e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35.69 
 
 		 346 aa  188  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.46 
 
 		 320 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.06 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 		 358 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3566  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 399 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.107446  normal  0.0714729 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3679  cobalamin synthesis protein, P47K  33.07 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.191921  normal  0.393021 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5139  cobalamin synthesis protein P47K  32.03 
 
 		 402 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5075  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.8 
 
 		 402 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  32.1 
 
 		 376 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 		 320 aa  186  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  34.8 
 
 		 406 aa  186  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 324 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  37.16 
 
 		 406 aa  186  7e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5410  cobalamin synthesis protein P47K  31.84 
 
 		 401 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.76 
 
 		 316 aa  185  8e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 329 aa  185  8e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  33.91 
 
 		 354 aa  185  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  34.45 
 
 		 316 aa  185  9e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  32.47 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  31.55 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.76 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  34.45 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.76 
 
 		 316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  31.99 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  32.89 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.45 
 
 		 400 aa  183  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6337  hypothetical protein  31.32 
 
 		 400 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.45 
 
 		 400 aa  183  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2719  cobalamin synthesis protein P47K  30.95 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.04 
 
 		 324 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5269  cobalamin synthesis protein, P47K  31.93 
 
 		 402 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.55186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>