More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1823 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  690    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  97.09 
 
 
342 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  60.82 
 
 
379 aa  457  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  60.82 
 
 
372 aa  457  1e-127  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  59.94 
 
 
349 aa  430  1e-119  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  61.72 
 
 
366 aa  419  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  60.95 
 
 
338 aa  385  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  53.19 
 
 
380 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  56.77 
 
 
357 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  49.21 
 
 
384 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  55.09 
 
 
362 aa  367  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  55.18 
 
 
362 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  52.99 
 
 
373 aa  359  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  50.86 
 
 
378 aa  354  1e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  50.86 
 
 
378 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  47.6 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  45.71 
 
 
353 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  46.76 
 
 
346 aa  306  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  47.02 
 
 
346 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  46.36 
 
 
327 aa  303  3.0000000000000004e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  45.92 
 
 
341 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  63.05 
 
 
362 aa  259  6e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  63.55 
 
 
383 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  58.62 
 
 
382 aa  250  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  36.14 
 
 
320 aa  226  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.64 
 
 
332 aa  222  9e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.53 
 
 
335 aa  218  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  37.65 
 
 
364 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.26 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 
320 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  38.41 
 
 
362 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.75 
 
 
320 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.61 
 
 
345 aa  212  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  37.16 
 
 
336 aa  212  7.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 
328 aa  212  7.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  37.13 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  35 
 
 
355 aa  211  1e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.87 
 
 
350 aa  211  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  36.09 
 
 
323 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  36.09 
 
 
323 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.31 
 
 
323 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  37.05 
 
 
324 aa  209  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.57 
 
 
347 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.64 
 
 
361 aa  208  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  34.19 
 
 
360 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.23 
 
 
343 aa  207  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.61 
 
 
349 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 
360 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  34.53 
 
 
367 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  34.63 
 
 
353 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 
350 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.6 
 
 
323 aa  202  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  33.99 
 
 
353 aa  202  6e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  33.8 
 
 
358 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.5 
 
 
326 aa  202  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  35.38 
 
 
369 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  33.43 
 
 
349 aa  201  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  34.76 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  37.01 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  33.43 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.93 
 
 
337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  34.66 
 
 
355 aa  197  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  34.34 
 
 
363 aa  197  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.09 
 
 
354 aa  195  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.12 
 
 
375 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  32.08 
 
 
364 aa  192  1e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  30.39 
 
 
400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2829  cobalamin synthesis protein P47K  30.15 
 
 
406 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.62152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  44.33 
 
 
369 aa  189  5e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  41.4 
 
 
460 aa  188  9e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2707  cobalamin synthesis protein P47K  29.72 
 
 
405 aa  188  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.217107 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  42.03 
 
 
457 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  31.77 
 
 
364 aa  188  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0639  cobalamin synthesis protein P47K  31.11 
 
 
402 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000744918  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  40.54 
 
 
393 aa  187  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.34 
 
 
324 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4724  cobalamin synthesis protein P47K  30.83 
 
 
376 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  31.61 
 
 
388 aa  186  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  41.51 
 
 
460 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  30.31 
 
 
408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.16 
 
 
374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2212  cobalamin synthesis protein P47K  29.22 
 
 
423 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614725  normal  0.208807 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 
408 aa  183  4.0000000000000006e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2934  cobalamin synthesis protein P47K  29.38 
 
 
406 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00608688 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  40.1 
 
 
460 aa  183  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  36.34 
 
 
353 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  36.18 
 
 
404 aa  182  6e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  34.69 
 
 
384 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  35.03 
 
 
352 aa  182  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  29.44 
 
 
406 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.87 
 
 
400 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.44 
 
 
319 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.14 
 
 
316 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.44 
 
 
316 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  29.64 
 
 
403 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  32.95 
 
 
346 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.87 
 
 
400 aa  181  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  35.35 
 
 
329 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  41.06 
 
 
449 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>