More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_3375 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  100 
 
 
388 aa  784    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  39.65 
 
 
449 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  43.12 
 
 
323 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  38.99 
 
 
449 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  38.55 
 
 
449 aa  286  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  38.97 
 
 
460 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  39.14 
 
 
460 aa  285  9e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  38.71 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  43.15 
 
 
360 aa  282  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  41.86 
 
 
394 aa  279  6e-74  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  44.42 
 
 
364 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  42.78 
 
 
375 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  41.03 
 
 
347 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  40.72 
 
 
404 aa  267  2e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  42.38 
 
 
369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 
320 aa  265  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  44.07 
 
 
393 aa  263  3e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  41.3 
 
 
343 aa  260  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  41.86 
 
 
354 aa  259  6e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  38.96 
 
 
358 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.53 
 
 
345 aa  256  3e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  41.04 
 
 
360 aa  255  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  39.48 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  40.57 
 
 
332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  40.16 
 
 
355 aa  253  3e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  42.08 
 
 
369 aa  253  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  41.75 
 
 
384 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.12 
 
 
374 aa  251  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  40.52 
 
 
363 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  40.16 
 
 
353 aa  250  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  39.58 
 
 
367 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  38.4 
 
 
316 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  39.43 
 
 
365 aa  245  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.4 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  38.4 
 
 
319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.4 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.4 
 
 
316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.14 
 
 
316 aa  244  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.14 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.14 
 
 
316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  37.89 
 
 
316 aa  241  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  38.24 
 
 
324 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  38.08 
 
 
326 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  38.21 
 
 
350 aa  237  2e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  37.24 
 
 
320 aa  236  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  39.9 
 
 
351 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.69 
 
 
337 aa  233  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  38.08 
 
 
322 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10239  predicted protein  38.85 
 
 
349 aa  229  6e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  39.43 
 
 
353 aa  229  9e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  40.72 
 
 
369 aa  228  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  39.18 
 
 
372 aa  226  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  53.36 
 
 
452 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  38.21 
 
 
352 aa  224  3e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  55.4 
 
 
493 aa  223  4.9999999999999996e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  38.08 
 
 
329 aa  223  6e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  54.29 
 
 
323 aa  222  7e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  52.19 
 
 
457 aa  219  7e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  36.86 
 
 
349 aa  218  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  53.33 
 
 
323 aa  216  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  37.37 
 
 
363 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.79 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.79 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  50.71 
 
 
346 aa  212  7e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  47.46 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  47.46 
 
 
323 aa  212  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  37.4 
 
 
362 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 
323 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  48.72 
 
 
339 aa  211  2e-53  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.13 
 
 
356 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1611  cobalamin synthesis protein/P47K  37.95 
 
 
366 aa  202  7e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  35.52 
 
 
379 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  47.66 
 
 
328 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  35.88 
 
 
372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  48.93 
 
 
352 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  47.2 
 
 
360 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  37.98 
 
 
384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  47.73 
 
 
329 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  48.58 
 
 
320 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  35.05 
 
 
380 aa  193  5e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  47.39 
 
 
363 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  46.45 
 
 
357 aa  189  8e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  45.5 
 
 
362 aa  186  8e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  47.37 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  48.84 
 
 
325 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  46.98 
 
 
393 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  46.98 
 
 
395 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.41 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  46.98 
 
 
387 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  33.98 
 
 
367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 
386 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  46.98 
 
 
388 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  32.31 
 
 
339 aa  182  6e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  45.02 
 
 
359 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  46.51 
 
 
393 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  46.45 
 
 
362 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  36.88 
 
 
379 aa  182  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  47.44 
 
 
323 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  47.39 
 
 
359 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  43.88 
 
 
324 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>