More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0042 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  100 
 
 
308 aa  620  1e-176  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  99.03 
 
 
308 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  46.62 
 
 
310 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  36.53 
 
 
333 aa  224  1e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  46.15 
 
 
360 aa  190  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  31.82 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  40.51 
 
 
345 aa  155  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  29.33 
 
 
316 aa  150  2e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  37.75 
 
 
324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  26.77 
 
 
341 aa  126  4.0000000000000003e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 
340 aa  122  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  34.48 
 
 
308 aa  122  6e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  33.71 
 
 
220 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  27.85 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  27.36 
 
 
340 aa  117  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  33 
 
 
329 aa  116  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  29.71 
 
 
339 aa  116  6e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  27.53 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  26.52 
 
 
358 aa  114  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  35.39 
 
 
344 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  27.82 
 
 
322 aa  112  6e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  27.66 
 
 
320 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.2 
 
 
324 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 
323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  31.71 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  25.96 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  27.38 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  34.27 
 
 
381 aa  109  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  32.4 
 
 
428 aa  108  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  26.36 
 
 
320 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  25.88 
 
 
313 aa  108  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  25.42 
 
 
298 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  37.01 
 
 
366 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  23.72 
 
 
322 aa  107  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  29.17 
 
 
347 aa  107  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  26.59 
 
 
335 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  24.32 
 
 
347 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  28.36 
 
 
375 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  26.69 
 
 
370 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  28.36 
 
 
368 aa  106  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  26.42 
 
 
328 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  26.42 
 
 
328 aa  106  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.56 
 
 
346 aa  106  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  24.91 
 
 
345 aa  106  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  27.37 
 
 
325 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  29.63 
 
 
378 aa  105  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  26.47 
 
 
325 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  28.36 
 
 
368 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  30.39 
 
 
360 aa  105  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 
493 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 
323 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  26.98 
 
 
323 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  28.5 
 
 
625 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  27.74 
 
 
332 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  26.47 
 
 
323 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  28.32 
 
 
388 aa  104  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  34.68 
 
 
368 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  26.1 
 
 
329 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 
363 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  25.37 
 
 
325 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  24.09 
 
 
346 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  31.1 
 
 
350 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  31.72 
 
 
325 aa  103  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  30.05 
 
 
331 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  29.13 
 
 
365 aa  103  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  29.9 
 
 
353 aa  103  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  30.77 
 
 
640 aa  103  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  25.55 
 
 
323 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  26.16 
 
 
323 aa  103  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  35.33 
 
 
329 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.78 
 
 
345 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  32.61 
 
 
363 aa  102  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  23.37 
 
 
349 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.12 
 
 
365 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  27.7 
 
 
369 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  28.17 
 
 
375 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  24.71 
 
 
360 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  29.08 
 
 
460 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  26.64 
 
 
460 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  35.22 
 
 
328 aa  101  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  31.48 
 
 
324 aa  101  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  29.27 
 
 
350 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  32.99 
 
 
326 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  27.16 
 
 
364 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.51 
 
 
323 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  32.07 
 
 
357 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  33.14 
 
 
351 aa  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  29.05 
 
 
404 aa  101  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  27.86 
 
 
337 aa  100  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  30.73 
 
 
358 aa  101  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.3 
 
 
327 aa  101  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  31.52 
 
 
369 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  24.12 
 
 
395 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2994  cobalamin synthesis protein P47K  31.52 
 
 
372 aa  100  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  26.24 
 
 
357 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  29.27 
 
 
350 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  29.9 
 
 
355 aa  100  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  25.4 
 
 
614 aa  99.8  5e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>