More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0338 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 333 aa  676    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  36.46 
 
 		 360 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  39.88 
 
 		 310 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  36.53 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  36.53 
 
 		 308 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  32.46 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  33.64 
 
 		 307 aa  180  2.9999999999999997e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  27.41 
 
 		 316 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  28.57 
 
 		 329 aa  130  4.0000000000000003e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  28.53 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  39.29 
 
 		 351 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  37.35 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 328 aa  119  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  27.98 
 
 		 341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.98 
 
 		 365 aa  117  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  29.1 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  29.66 
 
 		 360 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  36.87 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  39.49 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  38.3 
 
 		 339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  28.96 
 
 		 340 aa  114  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  40.26 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.5 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  36.36 
 
 		 347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  40.62 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  38.85 
 
 		 372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  38.85 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  27.95 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  34.41 
 
 		 395 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  36.82 
 
 		 493 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 340 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  32.38 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.86 
 
 		 375 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  28.57 
 
 		 326 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  33.17 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  30.48 
 
 		 457 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  29.66 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  26.81 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  38.22 
 
 		 370 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.23 
 
 		 356 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  32.39 
 
 		 404 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  32.72 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  37.11 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  37.2 
 
 		 328 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  27.7 
 
 		 320 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.52 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.72 
 
 		 343 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  32.11 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.71 
 
 		 353 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  32.86 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  29.97 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  31.8 
 
 		 354 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 		 375 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 		 391 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  38.31 
 
 		 330 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.26 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  35.92 
 
 		 368 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  32.11 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  33.19 
 
 		 460 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  33.19 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.35 
 
 		 346 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  28.74 
 
 		 347 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  30.17 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  35.5 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  32.57 
 
 		 367 aa  106  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  32.43 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  27.87 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  34.24 
 
 		 420 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  24.78 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  36.28 
 
 		 356 aa  105  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  36.61 
 
 		 324 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.57 
 
 		 360 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  35.16 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  37.99 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  35.43 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  37.22 
 
 		 449 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  31.6 
 
 		 360 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  36.71 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  32.3 
 
 		 460 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  33.18 
 
 		 355 aa  105  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  37.58 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  34.62 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  37.43 
 
 		 449 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  32.44 
 
 		 460 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 		 324 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  34.97 
 
 		 372 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  29.91 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  36.51 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  32.65 
 
 		 387 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1957  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.62 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  35.33 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  34.97 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  35.33 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  35.33 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  32.69 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  28.21 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>