More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1300 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 		 356 aa  733    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  46.48 
 
 		 375 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  46.76 
 
 		 368 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  46.48 
 
 		 368 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  46.76 
 
 		 368 aa  289  6e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  44.61 
 
 		 351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  44.98 
 
 		 351 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  45.26 
 
 		 336 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  43.16 
 
 		 340 aa  275  6e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  44.1 
 
 		 372 aa  275  9e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  44.1 
 
 		 367 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  44.7 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.05 
 
 		 365 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  42.34 
 
 		 378 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  44.48 
 
 		 334 aa  268  1e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  44 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  42.62 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  42.69 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  43.16 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  42.02 
 
 		 328 aa  255  7e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.15 
 
 		 346 aa  255  9e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  43.11 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  40.4 
 
 		 362 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  42.73 
 
 		 330 aa  250  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  41.54 
 
 		 324 aa  251  2e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  42.73 
 
 		 327 aa  247  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  42.06 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  42.06 
 
 		 327 aa  243  3e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  38.69 
 
 		 331 aa  242  7e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  39.49 
 
 		 364 aa  239  8e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  40.85 
 
 		 325 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  41.44 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  40.24 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  40.24 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  40.24 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  40.24 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  40.24 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  40.24 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  40.66 
 
 		 328 aa  232  9e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  40.24 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  37.77 
 
 		 331 aa  228  1e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  39.34 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  39.34 
 
 		 337 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  39.04 
 
 		 337 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  39.04 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  39.04 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  36.15 
 
 		 350 aa  215  8e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  38.02 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  35.41 
 
 		 347 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  34.42 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  34.37 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  36.97 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  36.06 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 		 340 aa  180  4e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  36.18 
 
 		 323 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  32.72 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  34.88 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  32.09 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  34.73 
 
 		 322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.42 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  32.45 
 
 		 324 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  32.33 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  32.09 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.1 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  33.95 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  27.93 
 
 		 369 aa  151  2e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  34.67 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  28.82 
 
 		 358 aa  136  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  39.04 
 
 		 190 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  35.83 
 
 		 378 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 333 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  34.44 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  35.54 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  37.79 
 
 		 328 aa  99.4  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.91 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  35.43 
 
 		 329 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  34.72 
 
 		 353 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  37.2 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  34.2 
 
 		 349 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  35.43 
 
 		 343 aa  96.7  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.71 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 		 364 aa  96.3  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.77 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  34.01 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 		 360 aa  95.9  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.36 
 
 		 345 aa  95.5  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.84 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  35.88 
 
 		 362 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  33.52 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  34.95 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.88 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.88 
 
 		 355 aa  95.1  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  36.88 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.98 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  37.72 
 
 		 344 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  33.75 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>