More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_2009 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 
318 aa  650    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  98.11 
 
 
320 aa  636    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  95.28 
 
 
328 aa  621  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  97.7 
 
 
307 aa  608  1e-173  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  98.03 
 
 
307 aa  607  1e-173  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  97.7 
 
 
305 aa  608  1e-173  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  97.7 
 
 
307 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  96.07 
 
 
307 aa  597  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  94.43 
 
 
307 aa  591  1e-168  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  94.1 
 
 
307 aa  589  1e-167  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  85.76 
 
 
310 aa  550  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  36.15 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  36.15 
 
 
296 aa  198  7.999999999999999e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0727  cobalamin synthesis protein P47K  35.5 
 
 
308 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0711  cobalamin synthesis protein, P47K  35.5 
 
 
308 aa  189  7e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  33.44 
 
 
308 aa  187  2e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  34.33 
 
 
293 aa  185  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  31.27 
 
 
335 aa  142  8e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  30.77 
 
 
298 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  30.43 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  30.43 
 
 
328 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  30.86 
 
 
320 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  30.12 
 
 
329 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  32.53 
 
 
395 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  31.51 
 
 
395 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  30.96 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  29.05 
 
 
355 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  29.6 
 
 
350 aa  126  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  29.05 
 
 
322 aa  125  7e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  29.48 
 
 
349 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 
320 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  31.16 
 
 
395 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.48 
 
 
345 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  28.98 
 
 
350 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  31.16 
 
 
395 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  30.67 
 
 
347 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  28.9 
 
 
353 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  28.67 
 
 
596 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  28.66 
 
 
313 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  31.16 
 
 
527 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  31.16 
 
 
395 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  27.89 
 
 
355 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  28.53 
 
 
361 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  30.82 
 
 
395 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  31.51 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  28.19 
 
 
648 aa  120  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  29.12 
 
 
364 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  28.65 
 
 
353 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  31.2 
 
 
349 aa  119  6e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.89 
 
 
327 aa  119  7e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  28.17 
 
 
319 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.48 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.48 
 
 
316 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  26.8 
 
 
394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.48 
 
 
319 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.48 
 
 
316 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30.51 
 
 
404 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.35 
 
 
316 aa  116  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  27.86 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  28 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  28.32 
 
 
640 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  26.96 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.24 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  31.54 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  28.67 
 
 
614 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.38 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  29.48 
 
 
323 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  27.92 
 
 
318 aa  113  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  29.26 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  30.15 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  29.01 
 
 
323 aa  113  5e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  28.17 
 
 
319 aa  112  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  28.66 
 
 
349 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.37 
 
 
324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  29.23 
 
 
320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  27.27 
 
 
380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  28.35 
 
 
341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  27.74 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  27.84 
 
 
329 aa  111  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  29.18 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  26.69 
 
 
400 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  28.57 
 
 
323 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  25.29 
 
 
345 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  28.28 
 
 
342 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1815  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.62 
 
 
402 aa  108  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.22864  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  29.15 
 
 
394 aa  108  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  28.11 
 
 
328 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1720  cobalamin synthesis protein P47K  25.94 
 
 
396 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00319553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  29.04 
 
 
346 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  27 
 
 
343 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3403  cobalamin synthesis protein P47K  28.4 
 
 
341 aa  107  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  29.29 
 
 
344 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  29.19 
 
 
352 aa  107  4e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  25.25 
 
 
406 aa  106  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  27.57 
 
 
373 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  27.86 
 
 
320 aa  106  5e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  27.88 
 
 
362 aa  105  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  28.57 
 
 
388 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0192  cobalamin synthesis protein, P47K  24.42 
 
 
410 aa  105  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2626  cobalamin synthesis protein P47K  26.44 
 
 
395 aa  105  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.153552  normal  0.53013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>