More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1417 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_1417  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.450327  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3487  cobalamin synthesis protein, P47K  98.62 
 
 		 315 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2744  cobalamin synthesis protein, P47K  35.92 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2035  cobalamin synthesis protein P47K  32.62 
 
 		 331 aa  122  8e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1001  cobalamin synthesis protein, P47K  32.46 
 
 		 337 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  31.9 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0962  putative GTP-binding protein YjiA  31.1 
 
 		 322 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.177818  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  30.52 
 
 		 320 aa  115  7.999999999999999e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  30.47 
 
 		 328 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4198  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.51 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  29.61 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6056  cobalamin synthesis protein P47K  28.9 
 
 		 345 aa  113  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268989  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3932  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  31.14 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134364 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0507  cobalamin synthesis protein P47K  30.79 
 
 		 377 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  34.72 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0674  ATP/GTP binding protein  27.43 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.499704  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  31.63 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  31.19 
 
 		 334 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2384  cobalamin synthesis protein P47K  37.7 
 
 		 364 aa  104  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00979398  hitchhiker  0.00264822 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5884  hypothetical protein  28.97 
 
 		 338 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  27.76 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  27.76 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  31.29 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5963  cobalamin synthesis protein P47K  31.27 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.103061  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  27.42 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0509  putative GTP-binding protein YjiA  28.81 
 
 		 317 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0635943 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  26.1 
 
 		 339 aa  102  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  31.56 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  27.62 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.21 
 
 		 325 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  30.85 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.6 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  32.99 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  32.86 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  31.07 
 
 		 323 aa  99.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  30.25 
 
 		 323 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  33.22 
 
 		 325 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1229  cobalamin synthesis protein, P47K  29.37 
 
 		 335 aa  99.8  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.469713 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  27.92 
 
 		 332 aa  99.4  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  31.21 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.45 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  24.78 
 
 		 352 aa  97.4  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2088  cobalamin synthesis protein P47K  30.56 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0467724 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0903  cobalamin synthesis protein P47K  27.73 
 
 		 382 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.492956  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3607  cobalamin synthesis protein P47K  30.39 
 
 		 394 aa  97.8  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4884  putative GTP-binding protein YjiA  28.42 
 
 		 318 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3895  cobalamin synthesis protein P47K  30.39 
 
 		 391 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00307533 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4684  cobalamin synthesis protein P47K  35.59 
 
 		 340 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  28.16 
 
 		 328 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  27.22 
 
 		 346 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  26.83 
 
 		 320 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4857  putative GTP-binding protein YjiA  28.42 
 
 		 318 aa  96.3  5e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  27.71 
 
 		 419 aa  96.3  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4936  putative GTP-binding protein YjiA  28.18 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.518194  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.56 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4783  putative GTP-binding protein YjiA  28.42 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.120567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4943  putative GTP-binding protein YjiA  28.18 
 
 		 318 aa  95.9  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.715992 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.55 
 
 		 316 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  30.85 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.73 
 
 		 316 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  30.85 
 
 		 361 aa  95.9  8e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.56 
 
 		 316 aa  95.5  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  28.85 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  24.83 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0231  cobalamin synthesis protein P47K  37.42 
 
 		 377 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.856785  normal  0.0246685 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1926  cobalamin synthesis protein P47K  30.63 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.165005 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  28.51 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5645  cobalamin synthesis protein P47K  30.28 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.354851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  25 
 
 		 316 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.69 
 
 		 345 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.83 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  29.97 
 
 		 337 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.2 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  24.83 
 
 		 319 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  24.2 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  31.22 
 
 		 353 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  25.35 
 
 		 326 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5629  cobalamin synthesis protein P47K  31.53 
 
 		 361 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.431844  normal  0.176187 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  28.32 
 
 		 329 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0359  cobalamin synthesis protein P47K  28.93 
 
 		 387 aa  93.6  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  32.04 
 
 		 395 aa  94  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3645  cobalamin synthesis protein P47K  27.7 
 
 		 318 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11430  cobalamin biosynthesis CobW-like domain protein  36.81 
 
 		 417 aa  93.2  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.717633  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0557  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 		 470 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17268 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  29.57 
 
 		 339 aa  93.2  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04218  predicted GTPase  27.36 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3714  putative GTP-binding protein YjiA  27.36 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04184  hypothetical protein  27.36 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5864  putative GTP-binding protein YjiA  27.36 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4572  putative GTP-binding protein YjiA  27.36 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4944  putative GTP-binding protein YjiA  27.36 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  24.55 
 
 		 319 aa  92.8  6e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4892  putative GTP-binding protein YjiA  27.36 
 
 		 318 aa  92.8  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4878  putative GTP-binding protein YjiA  27.36 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  32.99 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  30.69 
 
 		 347 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  30.85 
 
 		 350 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  29.38 
 
 		 355 aa  91.3  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2571  cobalamin synthesis protein P47K  31.67 
 
 		 382 aa  91.3  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0868503  normal  0.334928 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>