More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41587 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  100 
 
 
339 aa  679    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  41.35 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  41.16 
 
 
335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  39.35 
 
 
323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  39 
 
 
323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  41.91 
 
 
332 aa  217  2.9999999999999998e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  40.47 
 
 
320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  37.36 
 
 
343 aa  215  8e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  37.94 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  37.98 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  37.98 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  36.6 
 
 
364 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  40.94 
 
 
329 aa  210  3e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.29 
 
 
350 aa  210  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.49 
 
 
355 aa  208  8e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  40.59 
 
 
328 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  40.59 
 
 
328 aa  207  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  34.29 
 
 
369 aa  206  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  34.47 
 
 
365 aa  206  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10239  predicted protein  38.95 
 
 
349 aa  206  6e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.09 
 
 
349 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  39.77 
 
 
320 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.91 
 
 
347 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  35.23 
 
 
361 aa  203  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  35.23 
 
 
358 aa  202  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.57 
 
 
345 aa  202  7e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  35.16 
 
 
350 aa  202  9e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  38.73 
 
 
320 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.49 
 
 
363 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.11 
 
 
374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  35.38 
 
 
347 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  34.21 
 
 
355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 
367 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06191  CobW domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G11720)  38.42 
 
 
383 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.662409  decreased coverage  0.00296342 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  33.97 
 
 
353 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  37.01 
 
 
326 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  34.23 
 
 
354 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.54 
 
 
353 aa  194  3e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  36.04 
 
 
360 aa  192  7e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  37.46 
 
 
404 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36.47 
 
 
337 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  38.51 
 
 
339 aa  189  5e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  37.25 
 
 
334 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  37.25 
 
 
334 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  35.01 
 
 
328 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 
324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  34.07 
 
 
352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  32.25 
 
 
353 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  38.46 
 
 
323 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  45.71 
 
 
460 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  45.28 
 
 
460 aa  181  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  36.69 
 
 
322 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35.98 
 
 
346 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  45.71 
 
 
457 aa  179  8e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  36.69 
 
 
324 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44069  hypothetical protein  33.42 
 
 
414 aa  178  1e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.550726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  36.75 
 
 
325 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  34.47 
 
 
394 aa  177  2e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  45.24 
 
 
460 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  36.31 
 
 
323 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  34.43 
 
 
360 aa  176  4e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  44.76 
 
 
452 aa  176  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  30.84 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.14 
 
 
316 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  32.46 
 
 
329 aa  176  7e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  44.34 
 
 
393 aa  175  9e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.55 
 
 
375 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  34.01 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  36.13 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  44.29 
 
 
449 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  31.79 
 
 
366 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.04 
 
 
316 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.84 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.34 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  43.81 
 
 
449 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  31.23 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.24 
 
 
319 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  44.29 
 
 
449 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.54 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.54 
 
 
316 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  32.69 
 
 
349 aa  172  7.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.04 
 
 
316 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  31.77 
 
 
352 aa  172  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  35.55 
 
 
325 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  30.75 
 
 
319 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  30.49 
 
 
350 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  30.75 
 
 
316 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  32.12 
 
 
347 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4271  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.3 
 
 
325 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  31.77 
 
 
344 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  31.83 
 
 
342 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1091  putative GTP-binding protein YjiA  35.17 
 
 
328 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4636  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.62 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  47.2 
 
 
493 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3224  putative GTP-binding protein YjiA  33.94 
 
 
328 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0778191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  32.79 
 
 
369 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 
346 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 
346 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>