More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0107 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 318 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  73.98 
 
 		 318 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  47.85 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  39.62 
 
 		 366 aa  176  5e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  41.73 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  38.02 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  34.85 
 
 		 336 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  33.81 
 
 		 303 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  38.53 
 
 		 379 aa  145  6e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  34.74 
 
 		 364 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  38.53 
 
 		 372 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  35.67 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.39 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  37.21 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  37.05 
 
 		 290 aa  136  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  33.22 
 
 		 311 aa  136  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  33.45 
 
 		 362 aa  134  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  28.83 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  37.26 
 
 		 366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  36.5 
 
 		 320 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 349 aa  130  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  36.27 
 
 		 342 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  33.79 
 
 		 344 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4133  cobalamin synthesis protein P47K  32.35 
 
 		 424 aa  130  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  32.98 
 
 		 369 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.14 
 
 		 323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  36.67 
 
 		 382 aa  129  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  31.6 
 
 		 323 aa  129  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  35.05 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  29.23 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0294  cobalamin synthesis protein P47K  32.06 
 
 		 381 aa  128  1.0000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.226941 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  29.47 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.02 
 
 		 324 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  29.87 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  35.9 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  29.87 
 
 		 323 aa  126  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  35.71 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  30.42 
 
 		 320 aa  123  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  30.21 
 
 		 323 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  33.67 
 
 		 362 aa  122  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  30.72 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  34.78 
 
 		 362 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  35.38 
 
 		 373 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  37.04 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4773  cobalamin synthesis protein P47K  30.86 
 
 		 377 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0898546  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  30.07 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  27.72 
 
 		 341 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  34.31 
 
 		 362 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  31.75 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  26.64 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  33.5 
 
 		 383 aa  119  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0421  cobalamin synthesis protein P47K  33.11 
 
 		 401 aa  119  6e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 346 aa  119  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.6 
 
 		 388 aa  119  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  30.36 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  37.04 
 
 		 349 aa  119  7.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.98 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  32.21 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  30.31 
 
 		 356 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  35.08 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  29.23 
 
 		 335 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 		 393 aa  119  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 378 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  33.16 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  26.1 
 
 		 347 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 		 378 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  26.87 
 
 		 394 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4501  cobalamin synthesis protein, P47K  32.89 
 
 		 325 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  34.57 
 
 		 339 aa  116  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4633  cobalamin synthesis protein P47K  33.22 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4639  CobW/P47K family protein  32.56 
 
 		 323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  29.36 
 
 		 360 aa  115  7.999999999999999e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 346 aa  115  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.02 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.02 
 
 		 328 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2215  cobalamin synthesis protein P47K  30.87 
 
 		 400 aa  115  8.999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.574387  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1533  cobalamin synthesis protein P47K  31.23 
 
 		 422 aa  115  8.999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  31.87 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.22 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  30.47 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  31.98 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.29 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  33.52 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  33.9 
 
 		 350 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  33.71 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.29 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30.47 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398183 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  29.25 
 
 		 339 aa  114  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  34.47 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  30.05 
 
 		 452 aa  113  5e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  31.86 
 
 		 367 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.76 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  32.22 
 
 		 353 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  27.03 
 
 		 395 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07250  predicted GTPase, G3E family  37.09 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>