More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0818 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 
381 aa  769    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  54.42 
 
 
428 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  39.84 
 
 
344 aa  253  3e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  36.83 
 
 
366 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1061  cobalamin biosynthesis protein  42.42 
 
 
220 aa  157  4e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1106  cobalamin synthesis protein P47K  38.5 
 
 
230 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2574  cobalamin synthesis protein P47K  34.2 
 
 
208 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  38.2 
 
 
596 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  34.27 
 
 
308 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  34.27 
 
 
308 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  37.85 
 
 
362 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  39.66 
 
 
383 aa  106  7e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  37.99 
 
 
362 aa  103  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  28.88 
 
 
322 aa  102  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  32 
 
 
307 aa  101  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  37.29 
 
 
357 aa  101  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  32.24 
 
 
308 aa  100  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  30.45 
 
 
316 aa  99.8  6e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3476  cobalamin synthesis protein P47K  31.22 
 
 
202 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  34.43 
 
 
395 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  34.74 
 
 
310 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  32.43 
 
 
331 aa  99.4  1e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1476  cobalamin synthesis protein P47K  31.73 
 
 
408 aa  97.4  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  33.02 
 
 
395 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  33.02 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3568  putative cobalamin synthesis protein  33.49 
 
 
395 aa  96.7  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.490171  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 
384 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  34.59 
 
 
324 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1836  cobalamin synthesis protein, putative  32.08 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.196672  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1633  cobalamin synthesis protein  32.55 
 
 
527 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0829989  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  34.21 
 
 
328 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1760  cobalamin synthesis protein  32.55 
 
 
395 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1776  putative cobalamin synthesis protein  33.49 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  32.39 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2730  cobalamin synthesis protein, P47K  31.1 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0298  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.47 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  33.14 
 
 
310 aa  95.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0164  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.47 
 
 
369 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  31.64 
 
 
349 aa  95.1  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1101  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 
442 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  32.2 
 
 
640 aa  94.7  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.21 
 
 
320 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  36.13 
 
 
307 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  32.2 
 
 
379 aa  94.4  3e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.21 
 
 
307 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03818  nitrile hydratase activator  32.52 
 
 
441 aa  94.4  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.34 
 
 
307 aa  94  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  33.89 
 
 
324 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.21 
 
 
307 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.21 
 
 
307 aa  94  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  31.1 
 
 
406 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  34.74 
 
 
307 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  31.64 
 
 
372 aa  93.6  5e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.6 
 
 
305 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  36.11 
 
 
322 aa  93.2  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.21 
 
 
318 aa  93.2  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3105  cobalamin synthesis protein, P47K  30.62 
 
 
417 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.934746  normal  0.32479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 
357 aa  92.8  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2991  cobalamin synthesis protein P47K  32.82 
 
 
369 aa  92  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0647494  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  31.28 
 
 
457 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  32.39 
 
 
625 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2471  cobalamin synthesis protein P47K  29.08 
 
 
371 aa  92.4  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.286794  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  30.16 
 
 
360 aa  92.4  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.07 
 
 
320 aa  92  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1193  hypothetical protein  31.55 
 
 
442 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.619068  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  31.87 
 
 
373 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  27.32 
 
 
395 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0299  cobalamin synthesis protein, P47K  32.06 
 
 
415 aa  91.3  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.376987  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  32.96 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  32.22 
 
 
382 aa  92  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  31.82 
 
 
648 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  32.24 
 
 
293 aa  91.3  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  31.55 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 
394 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  32.96 
 
 
460 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  33.33 
 
 
366 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  35.14 
 
 
338 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  30.8 
 
 
327 aa  91.3  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  32.96 
 
 
460 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  36.67 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  36.67 
 
 
344 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  31.35 
 
 
614 aa  90.1  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  30 
 
 
329 aa  90.1  5e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  35.67 
 
 
330 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  31.84 
 
 
320 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 
323 aa  90.1  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  35.67 
 
 
347 aa  90.1  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15320  cobalamin synthesis protein P47K  34.67 
 
 
305 aa  89.7  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5321  cobalamin synthesis protein, P47K  31.07 
 
 
388 aa  89.4  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.78 
 
 
316 aa  89  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.96 
 
 
345 aa  89  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 
323 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 
323 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  32.34 
 
 
296 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  31.49 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  32.34 
 
 
296 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  29.52 
 
 
316 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.8 
 
 
360 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  30.93 
 
 
362 aa  88.6  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.96 
 
 
323 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>