More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0683 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 350 aa  703    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  67.87 
 
 		 347 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  44.59 
 
 		 324 aa  242  9e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  42.68 
 
 		 327 aa  239  5.999999999999999e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  40.98 
 
 		 331 aa  237  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  42.68 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  42.68 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  38.96 
 
 		 329 aa  230  3e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  37.19 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  42.07 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.26 
 
 		 356 aa  223  3e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  42.22 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  38.31 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  42.22 
 
 		 328 aa  219  5e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  35.84 
 
 		 330 aa  219  5e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  39.77 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  40.92 
 
 		 331 aa  215  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  40.83 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  40.83 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  40.83 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  40.83 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  40.83 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  40.83 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  40.83 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  40.83 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  39.87 
 
 		 325 aa  210  2e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  36.87 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  37.23 
 
 		 375 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  39.94 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  37.23 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  37.23 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  37.23 
 
 		 368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  39.57 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  39.57 
 
 		 337 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  39.57 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  39.57 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  39.57 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  37.01 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  39.49 
 
 		 328 aa  202  8e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  35.2 
 
 		 340 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  36.53 
 
 		 378 aa  199  7e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  35.73 
 
 		 362 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  34.12 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  38.08 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  36.45 
 
 		 372 aa  195  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  49.72 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  36.45 
 
 		 367 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.21 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  37.12 
 
 		 357 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  46.19 
 
 		 334 aa  192  8e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  34.85 
 
 		 351 aa  191  1e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  40.33 
 
 		 331 aa  191  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.2 
 
 		 365 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  50 
 
 		 340 aa  182  6e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  35.45 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  31.58 
 
 		 364 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  33.43 
 
 		 323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  37.37 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  31.36 
 
 		 395 aa  163  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  32.93 
 
 		 323 aa  159  9e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.83 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  37.46 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  39.06 
 
 		 322 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  31.68 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  45.29 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  32.23 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  46.81 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  34.72 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  28.24 
 
 		 369 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  32.54 
 
 		 325 aa  136  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  42.57 
 
 		 190 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  42.68 
 
 		 322 aa  124  3e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 		 384 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  32.78 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  34.36 
 
 		 378 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  36.09 
 
 		 324 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  37.61 
 
 		 320 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  29.55 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  33.77 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.13 
 
 		 344 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.57 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  36.22 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  29.62 
 
 		 333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.96 
 
 		 350 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.11 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 335 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.86 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.41 
 
 		 349 aa  112  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.69 
 
 		 319 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.08 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.87 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  32.9 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  38.75 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.45 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  37.71 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  36.7 
 
 		 313 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.71 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.77 
 
 		 360 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.57 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  35.35 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>