More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3006 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 310 aa  625  1e-178  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  46.62 
 
 		 308 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  45.98 
 
 		 308 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  39.57 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  60 
 
 		 360 aa  230  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  34.48 
 
 		 345 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0421  hypothetical protein  34.3 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26190  predicted GTPase, G3E family  26.42 
 
 		 329 aa  145  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  31.01 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1227  cobalamin synthesis protein P47K  27.69 
 
 		 341 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.381423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  35.54 
 
 		 340 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  32.78 
 
 		 351 aa  114  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  30.45 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  33.17 
 
 		 378 aa  112  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  27.3 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  26.23 
 
 		 614 aa  109  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  28.57 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  26.01 
 
 		 298 aa  109  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  33.71 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  30.45 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  30.45 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  29.34 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  35.36 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 337 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 362 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 328 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 368 aa  105  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  37.01 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.83 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 368 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  26.89 
 
 		 625 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  32.22 
 
 		 360 aa  103  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.65 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  26.86 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  31.65 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  26.26 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.93 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  29.71 
 
 		 351 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  28.57 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  26.26 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  33.71 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  33.71 
 
 		 327 aa  103  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  34.84 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  34.84 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  34.42 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  34.84 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  35.75 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  33.52 
 
 		 428 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  34.84 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  34.84 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  34.84 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  34.84 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  35.03 
 
 		 364 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  24.29 
 
 		 395 aa  101  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  34.84 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  34.84 
 
 		 328 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  31.93 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  32.95 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  25.32 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  31.41 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3106  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 395 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.405952 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2998  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249675 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  28.64 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  31.52 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4377  hypothetical protein  30.5 
 
 		 363 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2475  cobalamin synthesis protein, P47K  32.18 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.557967  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  31.01 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  31.01 
 
 		 367 aa  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3135  cobalamin synthesis protein, P47K  32.18 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470512  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3089  cobalamin synthesis protein, P47K  32.18 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.356771  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  28.41 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  28.14 
 
 		 357 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  29.69 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0345  cobalamin synthesis protein P47K  30.5 
 
 		 362 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.593082 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.19 
 
 		 344 aa  100  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  31.5 
 
 		 362 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  33.71 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  31.55 
 
 		 336 aa  99.8  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3084  cobalamin synthesis protein P47K  31.68 
 
 		 359 aa  99.8  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0517303 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  27.18 
 
 		 307 aa  99.8  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  23.53 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  26.86 
 
 		 328 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  27.93 
 
 		 364 aa  99  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  26.35 
 
 		 310 aa  99  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2658  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2604  cobalamin synthesis protein, P47K  32.97 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  28.74 
 
 		 351 aa  99  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  31.76 
 
 		 340 aa  99  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  36.22 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  31.15 
 
 		 325 aa  98.6  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.18 
 
 		 356 aa  97.8  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.54 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  27.18 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.54 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6439  cobalamin synthesis protein/P47K  31.68 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  26.54 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0800  cobalamin synthesis protein P47K  32.24 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0818  cobalamin synthesis protein, P47K  33.9 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.110941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>