More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2471 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  100 
 
 
328 aa  664    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  99.7 
 
 
328 aa  663    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
328 aa  664    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  100 
 
 
328 aa  664    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  99.7 
 
 
328 aa  663    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  664    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  99.09 
 
 
328 aa  657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  100 
 
 
328 aa  664    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  100 
 
 
328 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  87.5 
 
 
337 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  87.5 
 
 
337 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  87.5 
 
 
337 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  87.5 
 
 
328 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  87.2 
 
 
362 aa  596  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  83.13 
 
 
328 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  69.85 
 
 
324 aa  459  9.999999999999999e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  67.59 
 
 
327 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  67.28 
 
 
327 aa  442  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  67.59 
 
 
327 aa  442  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  66.15 
 
 
328 aa  440  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  65.54 
 
 
328 aa  438  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  65.43 
 
 
324 aa  431  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  66.67 
 
 
325 aa  425  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  43.48 
 
 
328 aa  272  6e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  45.34 
 
 
329 aa  271  9e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  44.69 
 
 
330 aa  270  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  44.72 
 
 
328 aa  268  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  41.57 
 
 
351 aa  238  9e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  42.44 
 
 
336 aa  238  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.24 
 
 
356 aa  232  6e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  46.1 
 
 
331 aa  232  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  41.74 
 
 
333 aa  227  2e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.96 
 
 
346 aa  225  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.04 
 
 
365 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  38.02 
 
 
372 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  38.02 
 
 
367 aa  218  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  37.33 
 
 
378 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  36.44 
 
 
351 aa  210  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  39.1 
 
 
334 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  36.75 
 
 
340 aa  206  3e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  37.75 
 
 
370 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  35.65 
 
 
362 aa  207  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  39.76 
 
 
350 aa  206  4e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  35.65 
 
 
357 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  40.68 
 
 
347 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  36.87 
 
 
368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  37.43 
 
 
368 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  36.87 
 
 
368 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  36.31 
 
 
375 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  36.74 
 
 
364 aa  199  7e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  34.37 
 
 
360 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  37.1 
 
 
331 aa  196  6e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  33.43 
 
 
351 aa  181  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  36.7 
 
 
340 aa  177  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  36.54 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  29.57 
 
 
395 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  36.36 
 
 
322 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  35.91 
 
 
324 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.55 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 
323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  33.23 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  33.02 
 
 
325 aa  147  3e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.12 
 
 
323 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  32.76 
 
 
378 aa  142  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  36.2 
 
 
322 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  33.54 
 
 
323 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  27.32 
 
 
358 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  27.2 
 
 
369 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  35.03 
 
 
324 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  34.24 
 
 
323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 
323 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  45.14 
 
 
190 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  30.49 
 
 
308 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  31.34 
 
 
344 aa  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.21 
 
 
318 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.3 
 
 
307 aa  104  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  27 
 
 
307 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.3 
 
 
307 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  28.51 
 
 
360 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  33.94 
 
 
310 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  35.71 
 
 
349 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  29.25 
 
 
322 aa  102  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.16 
 
 
305 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.18 
 
 
307 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.18 
 
 
320 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  34.16 
 
 
307 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.18 
 
 
307 aa  101  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  34.07 
 
 
353 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  33.95 
 
 
333 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  26.24 
 
 
328 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.26 
 
 
344 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  33.64 
 
 
313 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2386  cobalamin synthesis protein, putative  32.26 
 
 
293 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0757  divalent cation transport protein  32.96 
 
 
366 aa  99  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000343665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  36.63 
 
 
323 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  36.63 
 
 
323 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  30.84 
 
 
327 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  32.28 
 
 
596 aa  98.2  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  29.57 
 
 
324 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.71 
 
 
323 aa  97.1  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>