More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0456 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 358 aa  738    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  33.99 
 
 		 325 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  31.92 
 
 		 351 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  28.41 
 
 		 333 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  28.96 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  31.91 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  34.94 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  31.56 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  32.28 
 
 		 351 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  29.38 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  28.72 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  34.36 
 
 		 350 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  28.82 
 
 		 357 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  27.32 
 
 		 328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  28.42 
 
 		 375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  27.32 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  27.32 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  27.32 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  27.32 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  27.32 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  27.32 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  27.32 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.88 
 
 		 365 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  27.39 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  28.73 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  28.61 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  27.97 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  27.04 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.82 
 
 		 356 aa  136  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  25.98 
 
 		 346 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  26.18 
 
 		 328 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  29.24 
 
 		 340 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  26.58 
 
 		 378 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  30.18 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  26.33 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  26.47 
 
 		 328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  26.05 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  26.2 
 
 		 328 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  26.05 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  27.35 
 
 		 378 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  25.66 
 
 		 340 aa  134  3e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  27.37 
 
 		 368 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  27.08 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  26.05 
 
 		 362 aa  133  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  28.33 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  28.33 
 
 		 327 aa  133  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  27.81 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  27.88 
 
 		 367 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  26.16 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  27.88 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  27.1 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  26.52 
 
 		 369 aa  129  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  27.65 
 
 		 364 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.02 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  26.36 
 
 		 370 aa  126  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  25.82 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  26.65 
 
 		 325 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  26.29 
 
 		 395 aa  123  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  26.36 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  32.31 
 
 		 347 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  28.53 
 
 		 323 aa  123  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  25.77 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  27.45 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  29.12 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  27.79 
 
 		 322 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  29.36 
 
 		 323 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  27.57 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  26.83 
 
 		 308 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  29.08 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  26.52 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  26.82 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  25.71 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  27.35 
 
 		 322 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  35.5 
 
 		 333 aa  106  5e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  28.45 
 
 		 324 aa  106  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  37.57 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  34.22 
 
 		 625 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  34.71 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  34.12 
 
 		 383 aa  103  4e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  38.04 
 
 		 322 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.48 
 
 		 324 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  37.72 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  29.56 
 
 		 365 aa  102  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  33.53 
 
 		 362 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  32.41 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  32.04 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  36.57 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  29 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  31.02 
 
 		 327 aa  100  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  34.12 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  36.2 
 
 		 353 aa  100  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  33.69 
 
 		 382 aa  99.8  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  31.52 
 
 		 353 aa  99.4  8e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  25.81 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  27.62 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  27.62 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  35.4 
 
 		 364 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  28.17 
 
 		 352 aa  98.6  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  31.69 
 
 		 349 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  35.83 
 
 		 342 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>