More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2829 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  87.12 
 
 		 370 aa  665    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 372 aa  756    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 367 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  78.96 
 
 		 365 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  66.85 
 
 		 368 aa  498  1e-140  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  66.31 
 
 		 368 aa  495  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  66.04 
 
 		 368 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  65.68 
 
 		 375 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  66.22 
 
 		 360 aa  483  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  50.13 
 
 		 378 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  51.2 
 
 		 351 aa  362  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  47.44 
 
 		 351 aa  342  8e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  47.67 
 
 		 346 aa  326  3e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  47.3 
 
 		 357 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  43.86 
 
 		 362 aa  311  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  47.4 
 
 		 364 aa  300  3e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.1 
 
 		 356 aa  274  1.0000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  42.34 
 
 		 336 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  40.55 
 
 		 330 aa  253  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  41.5 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  42.32 
 
 		 340 aa  246  4e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  38.44 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  37.85 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  38.48 
 
 		 327 aa  228  9e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  37.57 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  38.38 
 
 		 327 aa  225  9e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  36.67 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  37.78 
 
 		 331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  38.02 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  38.02 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  38.02 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  38.66 
 
 		 337 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  38.29 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  38.02 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  38.02 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  38.55 
 
 		 324 aa  218  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  38.4 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  38.02 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  38.02 
 
 		 328 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  37.29 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  37.29 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  38.4 
 
 		 362 aa  215  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  37.36 
 
 		 324 aa  215  8e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  37.74 
 
 		 328 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  36.62 
 
 		 325 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  37.22 
 
 		 328 aa  206  5e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  57.96 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  35.89 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  36.45 
 
 		 350 aa  192  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  54.37 
 
 		 347 aa  189  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  34.43 
 
 		 333 aa  188  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  31.2 
 
 		 395 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  32.25 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  31.78 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  30.72 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  47.85 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  32.23 
 
 		 322 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  30.98 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  30.08 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.92 
 
 		 323 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  45.25 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  46.67 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  30.95 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  55.65 
 
 		 322 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  47.18 
 
 		 190 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  45.86 
 
 		 323 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  30.62 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  48.78 
 
 		 324 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  29.46 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  27.88 
 
 		 358 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  38.07 
 
 		 378 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  38.85 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  32.9 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.38 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.43 
 
 		 349 aa  103  7e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  32.51 
 
 		 313 aa  99.4  9e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  37.2 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  24.05 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  22.47 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  34.36 
 
 		 366 aa  97.4  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  34.16 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  36 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 		 325 aa  97.4  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  36.73 
 
 		 375 aa  96.7  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  35.37 
 
 		 353 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  38.55 
 
 		 322 aa  96.3  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.52 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  35.62 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  37.74 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  35.62 
 
 		 327 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 		 384 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  36.2 
 
 		 460 aa  94.7  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.95 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.52 
 
 		 355 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.02 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  30.05 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.52 
 
 		 358 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.52 
 
 		 355 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>