More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06411 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  690    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  59.75 
 
 		 336 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  44.99 
 
 		 378 aa  288  7e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  44.48 
 
 		 340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.09 
 
 		 356 aa  281  8.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  43.77 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  44.73 
 
 		 351 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  42.18 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  42.31 
 
 		 357 aa  259  4e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  39.89 
 
 		 362 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  40.38 
 
 		 375 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  40.38 
 
 		 368 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  40.43 
 
 		 368 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  41.29 
 
 		 372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  42.07 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.27 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  40.11 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  40.76 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  41.85 
 
 		 330 aa  248  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  41.64 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  41.85 
 
 		 328 aa  243  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  38.95 
 
 		 364 aa  241  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  44.38 
 
 		 331 aa  239  2.9999999999999997e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.88 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  42.77 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  42.22 
 
 		 327 aa  235  9e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  42.39 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  39.76 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  41.9 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  41.9 
 
 		 327 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  42.81 
 
 		 329 aa  228  9e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  40.58 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  40.58 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  40.58 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  40.58 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  40.58 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  40.58 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  40.58 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  40.58 
 
 		 328 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  40.58 
 
 		 328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  39.74 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  39.74 
 
 		 337 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  39.74 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  39.42 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  39.42 
 
 		 337 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  38.84 
 
 		 325 aa  211  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  36.92 
 
 		 333 aa  205  8e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  36.94 
 
 		 331 aa  202  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  39.81 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  38.14 
 
 		 331 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  48.15 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  46.19 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  32.02 
 
 		 395 aa  182  1e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  35.59 
 
 		 340 aa  179  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.74 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.65 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  33.33 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  34.32 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  32.52 
 
 		 323 aa  164  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  31.01 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  31.74 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  32.42 
 
 		 323 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  34.63 
 
 		 322 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  32.26 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  32.84 
 
 		 324 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  33.22 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  31.78 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  29.6 
 
 		 325 aa  137  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  26.14 
 
 		 358 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  38.71 
 
 		 190 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  33.17 
 
 		 378 aa  126  6e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  29.66 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.89 
 
 		 335 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  31.9 
 
 		 380 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  40.12 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  34.5 
 
 		 327 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  36.96 
 
 		 343 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  35.53 
 
 		 355 aa  107  4e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.15 
 
 		 386 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  34.31 
 
 		 384 aa  105  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.03 
 
 		 334 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.04 
 
 		 349 aa  105  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.33 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.33 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.33 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  32.59 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  33.85 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.17 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  33.85 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.61 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  35.56 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  32.83 
 
 		 362 aa  103  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.36 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  32.5 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.76 
 
 		 349 aa  103  6e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.74 
 
 		 316 aa  102  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.33 
 
 		 354 aa  102  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.33 
 
 		 355 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>