More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5523 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  100 
 
 		 323 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  84.21 
 
 		 323 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  66.46 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  60.12 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  59.5 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  59.38 
 
 		 323 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  59.81 
 
 		 323 aa  360  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  62.73 
 
 		 324 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  59.19 
 
 		 323 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  53.21 
 
 		 322 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  53.4 
 
 		 322 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 		 351 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  32.36 
 
 		 375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  37.27 
 
 		 331 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 368 aa  170  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  31.99 
 
 		 368 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  32.18 
 
 		 368 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  32.92 
 
 		 336 aa  169  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  35.05 
 
 		 334 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  32.06 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  34.89 
 
 		 340 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  36.06 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  33.15 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  33.24 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  31.4 
 
 		 360 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  34.21 
 
 		 331 aa  159  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  32.19 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  30.3 
 
 		 362 aa  159  7e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.49 
 
 		 365 aa  157  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  30.57 
 
 		 351 aa  157  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  45.83 
 
 		 350 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  29.92 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  29.86 
 
 		 370 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  35.17 
 
 		 340 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  29.92 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  32.65 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  35.24 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  56.59 
 
 		 346 aa  153  4e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.1 
 
 		 356 aa  152  8e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  34.35 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  54.2 
 
 		 378 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  34.04 
 
 		 328 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  34.94 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  34.94 
 
 		 327 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  30.89 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  33.53 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  32.93 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  30.23 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 		 328 aa  145  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  34.12 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  34.12 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  34.12 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  34.12 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  34.12 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  34.23 
 
 		 328 aa  143  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  28.57 
 
 		 330 aa  143  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  33.63 
 
 		 328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  32.59 
 
 		 333 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  45.78 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  34.23 
 
 		 337 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  33.93 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  33.93 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  33.93 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  33.23 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  32.29 
 
 		 325 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  30.5 
 
 		 325 aa  129  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  34.15 
 
 		 331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  27.02 
 
 		 358 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  36.17 
 
 		 190 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  27.5 
 
 		 351 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  28.33 
 
 		 378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  24.18 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  24.51 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.15 
 
 		 320 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.15 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.15 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  29.65 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  36.17 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.15 
 
 		 305 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  29.71 
 
 		 333 aa  96.3  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.65 
 
 		 318 aa  95.9  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  36 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  29.65 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.34 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.48 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.04 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.33 
 
 		 349 aa  94.7  2e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  28.64 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  39.56 
 
 		 364 aa  93.2  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.14 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.14 
 
 		 307 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  27.64 
 
 		 310 aa  92.4  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  33.86 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.86 
 
 		 349 aa  92  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.02 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  36.32 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.69 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.03 
 
 		 386 aa  91.7  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.51 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>