More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_01740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  100 
 
 		 324 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  59.5 
 
 		 323 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  59.5 
 
 		 323 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  59.94 
 
 		 323 aa  358  8e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  63.78 
 
 		 324 aa  350  2e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  54.04 
 
 		 323 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  50.93 
 
 		 323 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  49.38 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  50.31 
 
 		 323 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  56.31 
 
 		 322 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  55.59 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  34.05 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  37.88 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  36.73 
 
 		 331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  31.49 
 
 		 351 aa  164  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  31.91 
 
 		 351 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 		 375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  33.52 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  33.33 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  33.79 
 
 		 368 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  33.24 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  37.58 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  37.58 
 
 		 327 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.95 
 
 		 356 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  37.22 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  33.23 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  32.79 
 
 		 364 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  45.25 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  45.25 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  36.67 
 
 		 324 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  52.63 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  56.39 
 
 		 346 aa  151  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.52 
 
 		 365 aa  150  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  32.12 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  46.81 
 
 		 350 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  36.48 
 
 		 333 aa  149  9e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  29.64 
 
 		 362 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  34.08 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  34.43 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  33.64 
 
 		 340 aa  145  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  32.42 
 
 		 334 aa  142  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  31.97 
 
 		 329 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  43.69 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 324 aa  139  4.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  34.93 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  35.03 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  35.03 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  35.03 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  35.03 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  35.03 
 
 		 328 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  34.93 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  34.93 
 
 		 328 aa  139  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  35.05 
 
 		 362 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  31.5 
 
 		 369 aa  136  4e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  43.98 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  43.98 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  43.98 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  43.98 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  51.91 
 
 		 340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  40.31 
 
 		 328 aa  134  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  43.39 
 
 		 325 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  36.83 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  44.16 
 
 		 328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  31.09 
 
 		 328 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  30.45 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  30.72 
 
 		 325 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  47.66 
 
 		 190 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  30.23 
 
 		 378 aa  117  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  31.54 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  26.82 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  41.54 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.02 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  37.11 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.3 
 
 		 349 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  26.92 
 
 		 310 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  38.1 
 
 		 311 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.54 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  27.05 
 
 		 307 aa  90.1  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.4 
 
 		 307 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.54 
 
 		 320 aa  89.4  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.4 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  27.05 
 
 		 307 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.54 
 
 		 307 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.54 
 
 		 307 aa  89.4  9e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  34.59 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  35.64 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.87 
 
 		 349 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  27.05 
 
 		 328 aa  87.8  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.48 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.19 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.48 
 
 		 349 aa  86.3  7e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  33.48 
 
 		 349 aa  85.9  8e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.56 
 
 		 354 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  27.95 
 
 		 324 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  31.11 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  30.61 
 
 		 336 aa  84.7  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  34.9 
 
 		 336 aa  83.6  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.58 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>