More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3651 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 190 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  47.89 
 
 		 360 aa  148  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  43.16 
 
 		 375 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  47.89 
 
 		 365 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  43.16 
 
 		 368 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  43.16 
 
 		 368 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  47.18 
 
 		 372 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  47.18 
 
 		 367 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  43.16 
 
 		 368 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  44.08 
 
 		 340 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  45.77 
 
 		 370 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  39.89 
 
 		 351 aa  141  7e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  45.58 
 
 		 346 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  42.77 
 
 		 331 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  42.07 
 
 		 351 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  39.15 
 
 		 324 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  37.57 
 
 		 327 aa  138  6e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  44.03 
 
 		 322 aa  137  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  36.28 
 
 		 362 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  43.42 
 
 		 378 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  42.77 
 
 		 330 aa  135  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  43.24 
 
 		 328 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.04 
 
 		 356 aa  134  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  45.14 
 
 		 328 aa  134  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  44.37 
 
 		 357 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  40.24 
 
 		 340 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  44.44 
 
 		 337 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  44.44 
 
 		 362 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  44.44 
 
 		 337 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  43.84 
 
 		 328 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  44.44 
 
 		 337 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  44.44 
 
 		 328 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  37.04 
 
 		 327 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  37.04 
 
 		 327 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  45.83 
 
 		 325 aa  132  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  42.57 
 
 		 350 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  44.44 
 
 		 328 aa  131  6.999999999999999e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  40.52 
 
 		 336 aa  131  6.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  38.22 
 
 		 323 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  40.32 
 
 		 323 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  37.06 
 
 		 331 aa  128  6e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  42.75 
 
 		 364 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  44.67 
 
 		 329 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  47.29 
 
 		 324 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  38.71 
 
 		 334 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  43.06 
 
 		 324 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  37.65 
 
 		 395 aa  125  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.17 
 
 		 323 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  48.78 
 
 		 322 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  39.89 
 
 		 324 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  41.22 
 
 		 323 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  39.19 
 
 		 347 aa  122  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  41.33 
 
 		 328 aa  121  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  39.04 
 
 		 323 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  42 
 
 		 328 aa  120  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  39.88 
 
 		 323 aa  118  6e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  40.52 
 
 		 333 aa  118  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  39.88 
 
 		 323 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  39.07 
 
 		 331 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  34.87 
 
 		 369 aa  112  5e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  32.48 
 
 		 351 aa  110  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  34.12 
 
 		 325 aa  101  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  37.3 
 
 		 333 aa  91.7  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  33.33 
 
 		 378 aa  91.3  9e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  40.37 
 
 		 360 aa  91.3  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  28.09 
 
 		 358 aa  89.7  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 		 345 aa  81.6  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  38 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  38 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  39.18 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  29.83 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.26 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.26 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.26 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  32.26 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.26 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.26 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  32.54 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.26 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.26 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  32.26 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  32.26 
 
 		 328 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  33.56 
 
 		 322 aa  73.9  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.15 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  28.64 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1285  cobalamin synthesis protein P47K  31.62 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1056  CobW protein  31.75 
 
 		 428 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.23 
 
 		 316 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3006  cobalamin synthesis protein P47K  38.61 
 
 		 310 aa  72  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.23 
 
 		 316 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.72 
 
 		 316 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0960  putative GTP-binding protein YjiA  28.25 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.46622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>