More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1986 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1986  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 336 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  59.33 
 
 		 318 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4358  cobalamin synthesis protein P47K  47.66 
 
 		 310 aa  276  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  42.6 
 
 		 345 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6051  cobalamin synthesis protein P47K  43.53 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3108  cobalamin synthesis protein, P47K  35.12 
 
 		 362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.190819  normal  0.352092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5665  cobalamin synthesis protein P47K  38.03 
 
 		 320 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0326957 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  33.64 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  34.6 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3251  cobalamin synthesis protein, P47K  35.89 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.784399  normal  0.367551 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4296  cobalamin synthesis protein, P47K  37.72 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.385806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  34.9 
 
 		 349 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  29.89 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4765  cobalamin synthesis protein P47K  47.34 
 
 		 330 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0107  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 318 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0640379  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2949  cobalamin synthesis protein P47K  31.07 
 
 		 369 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.645626  hitchhiker  0.00151664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4288  cobalamin synthesis protein, P47K  45.98 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  29.03 
 
 		 349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  28.44 
 
 		 342 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  29.48 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0123  cobalamin synthesis protein, P47K  34.04 
 
 		 287 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  30.18 
 
 		 341 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  28.53 
 
 		 344 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  38.05 
 
 		 379 aa  139  4.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  38.05 
 
 		 372 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0750  cobalamin synthesis protein P47K  32.87 
 
 		 320 aa  139  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  26.18 
 
 		 357 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0133  cobalamin synthesis protein, P47K  33.23 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  27.79 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  30.67 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  25.07 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  28.66 
 
 		 349 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  27.76 
 
 		 380 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.77 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  31.9 
 
 		 452 aa  134  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2838  cobalamin synthesis protein P47K  29.97 
 
 		 356 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  31.06 
 
 		 449 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  31.9 
 
 		 449 aa  132  6e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  31.06 
 
 		 449 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  27.14 
 
 		 346 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 384 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  27.43 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  33.16 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0681  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 		 373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.01 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.43 
 
 		 337 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.71 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  28.12 
 
 		 353 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  35.38 
 
 		 355 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2341  cobalamin synthesis protein P47K  35.12 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  35.12 
 
 		 378 aa  129  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  35.86 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  36.92 
 
 		 361 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  25.87 
 
 		 362 aa  128  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  33.67 
 
 		 362 aa  129  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  35.75 
 
 		 349 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  35.12 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  35.03 
 
 		 353 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.41 
 
 		 374 aa  127  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0163  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  29.15 
 
 		 357 aa  127  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  28.91 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0608  cobalamin synthesis protein P47K  32.47 
 
 		 408 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.452974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  30.3 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.04 
 
 		 345 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  27.22 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  36.04 
 
 		 350 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3017  cobalamin synthesis protein P47K  30.97 
 
 		 415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168872  normal  0.358971 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  36.41 
 
 		 393 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  30.6 
 
 		 460 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  30.6 
 
 		 460 aa  126  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  36.67 
 
 		 363 aa  126  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.41 
 
 		 343 aa  125  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  35.2 
 
 		 365 aa  125  8.000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  30.51 
 
 		 460 aa  125  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  29.5 
 
 		 364 aa  125  9e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3703  cobalamin synthesis protein P47K  36 
 
 		 362 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.847645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  34.87 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2945  cobalamin synthesis protein P47K  30.9 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.879984  hitchhiker  0.0065134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.02 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  30.87 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1611  cobalamin synthesis protein  27.78 
 
 		 395 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.661095  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  28.16 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.95 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.95 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  36.76 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  37.24 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0047  hypothetical protein  36 
 
 		 362 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1584  cobalamin synthesis protein  27.78 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0280902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1810  putative cobalamin synthesis protein  27.45 
 
 		 395 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2203  putative regulatory protein (nitrile hydratase activator like)  31.9 
 
 		 401 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.514388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.94 
 
 		 326 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0127  cobalamin synthesis protein P47K  35.5 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.150599 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0485  cobalamin synthesis protein P47K  30 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  35.5 
 
 		 359 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0473  cobalamin synthesis protein, P47K  30 
 
 		 400 aa  123  5e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  35.61 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  30.08 
 
 		 457 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3684  cobalamin synthesis protein, P47K  35.64 
 
 		 369 aa  122  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>