More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_72980 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  100 
 
 		 322 aa  627  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  81.68 
 
 		 322 aa  474  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  53.09 
 
 		 323 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  53.09 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  53.21 
 
 		 323 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  56.31 
 
 		 324 aa  305  9.000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  53.42 
 
 		 323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  57.98 
 
 		 324 aa  293  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  51.08 
 
 		 323 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  50.15 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  48.92 
 
 		 323 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  40.38 
 
 		 331 aa  186  4e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  34.82 
 
 		 360 aa  175  8e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  31.78 
 
 		 375 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  37.65 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  33.42 
 
 		 378 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  31.51 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.88 
 
 		 346 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  36.83 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  31.51 
 
 		 368 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  31.51 
 
 		 368 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.07 
 
 		 365 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  37.62 
 
 		 350 aa  165  8e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  36.04 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.73 
 
 		 356 aa  163  4.0000000000000004e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  33.03 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  32.63 
 
 		 336 aa  162  9e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  36.87 
 
 		 357 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  32.23 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  32.23 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  36.23 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  36.23 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  37.84 
 
 		 331 aa  158  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  32.38 
 
 		 351 aa  158  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  31.59 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  55.64 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  34.43 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  33.73 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  34.43 
 
 		 337 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  35.45 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  36.36 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  30.56 
 
 		 395 aa  157  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  36.36 
 
 		 328 aa  157  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  36.36 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  34.13 
 
 		 337 aa  156  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  36.36 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  36.36 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  36.36 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  36.36 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  36.36 
 
 		 328 aa  156  4e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  33.06 
 
 		 364 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  48.47 
 
 		 351 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  34.13 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  33.73 
 
 		 328 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  30 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  33.83 
 
 		 362 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  35.29 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  50.6 
 
 		 347 aa  151  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  33.02 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 		 325 aa  149  6e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  46.07 
 
 		 340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  33.55 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  34.58 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  35.49 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  48.85 
 
 		 340 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  33.55 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  44.03 
 
 		 190 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  34.74 
 
 		 331 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  29.69 
 
 		 325 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  27.45 
 
 		 358 aa  120  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  37.13 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.17 
 
 		 349 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.4 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.67 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  32.67 
 
 		 349 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  40.62 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.67 
 
 		 369 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  33 
 
 		 344 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  35.06 
 
 		 378 aa  99.4  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.57 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.76 
 
 		 349 aa  98.6  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  35.4 
 
 		 367 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.39 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.21 
 
 		 349 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  29.31 
 
 		 324 aa  97.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.94 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  37.36 
 
 		 335 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  31.61 
 
 		 307 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.76 
 
 		 334 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  35.68 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  38.18 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.53 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  33.95 
 
 		 333 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.12 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  30.46 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  30.46 
 
 		 328 aa  94  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.09 
 
 		 349 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.53 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  34.8 
 
 		 335 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  33.66 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>