More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  100 
 
 
375 aa  752    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  96.57 
 
 
350 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  83.14 
 
 
349 aa  553  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  78.81 
 
 
355 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  78.15 
 
 
358 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  79.04 
 
 
354 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  79.04 
 
 
355 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  79.38 
 
 
355 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  80.29 
 
 
354 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  77.25 
 
 
357 aa  525  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  62.16 
 
 
386 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  65.59 
 
 
357 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  64.84 
 
 
390 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  65.29 
 
 
357 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  65.29 
 
 
357 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  65.29 
 
 
357 aa  427  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  65.29 
 
 
357 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  65.29 
 
 
357 aa  427  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  67.33 
 
 
349 aa  423  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  61.41 
 
 
367 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  61.19 
 
 
363 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.29 
 
 
362 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  62.01 
 
 
362 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.01 
 
 
362 aa  395  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  60.89 
 
 
362 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.11 
 
 
362 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  59.94 
 
 
369 aa  389  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.11 
 
 
362 aa  388  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  59.56 
 
 
369 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.86 
 
 
349 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.49 
 
 
349 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.68 
 
 
349 aa  365  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.09 
 
 
349 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.6 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  57.14 
 
 
360 aa  352  5e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.51 
 
 
354 aa  350  3e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.11 
 
 
358 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.6 
 
 
357 aa  346  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  54.02 
 
 
349 aa  343  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  53.64 
 
 
348 aa  344  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.85 
 
 
348 aa  344  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  53.64 
 
 
345 aa  341  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.74 
 
 
349 aa  341  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.33 
 
 
344 aa  340  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  55.43 
 
 
346 aa  340  2e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.68 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.02 
 
 
344 aa  334  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.96 
 
 
343 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.22 
 
 
343 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.3 
 
 
344 aa  329  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.3 
 
 
344 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.72 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.71 
 
 
349 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.68 
 
 
348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
344 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.45 
 
 
344 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.94 
 
 
344 aa  312  7.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  50.43 
 
 
343 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.56 
 
 
359 aa  298  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  50.14 
 
 
350 aa  296  4e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  48.12 
 
 
344 aa  293  4e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
345 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.29 
 
 
345 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  50.29 
 
 
345 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  51.02 
 
 
350 aa  287  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  51.78 
 
 
350 aa  279  7e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  46.67 
 
 
334 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  43.63 
 
 
344 aa  266  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  46.36 
 
 
335 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  43.6 
 
 
371 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  45.45 
 
 
335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  41.99 
 
 
351 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  44.01 
 
 
369 aa  251  1e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  39.73 
 
 
381 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  41.18 
 
 
364 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  34.2 
 
 
354 aa  222  8e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  34.5 
 
 
354 aa  221  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  34.41 
 
 
354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  34.83 
 
 
350 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.84 
 
 
323 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.84 
 
 
323 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  36.42 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  36.72 
 
 
323 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  36.47 
 
 
320 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  38.01 
 
 
329 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  37.46 
 
 
328 aa  182  7e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  37.46 
 
 
328 aa  182  7e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.04 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  33.77 
 
 
375 aa  177  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  34.29 
 
 
323 aa  178  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  33.71 
 
 
323 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  36.8 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 
320 aa  172  9e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  35.46 
 
 
347 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  33.43 
 
 
404 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  35.42 
 
 
320 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  35.46 
 
 
337 aa  171  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  33.9 
 
 
343 aa  169  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  34.4 
 
 
394 aa  168  2e-40  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35.1 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>