More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2776 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  100 
 
 		 357 aa  733    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  48.74 
 
 		 351 aa  346  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  49.2 
 
 		 368 aa  331  1e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  48.94 
 
 		 368 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  49.87 
 
 		 360 aa  329  4e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  48.67 
 
 		 375 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  48.94 
 
 		 368 aa  329  5.0000000000000004e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  48.95 
 
 		 378 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  46.7 
 
 		 351 aa  325  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  48.39 
 
 		 370 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  47.3 
 
 		 372 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  47.3 
 
 		 367 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  48.1 
 
 		 365 aa  310  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  43.7 
 
 		 362 aa  296  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  46.91 
 
 		 346 aa  295  7e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  46.53 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.69 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  41.3 
 
 		 331 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  42.39 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  41.67 
 
 		 336 aa  248  1e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  41.44 
 
 		 340 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  36.97 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  37.82 
 
 		 328 aa  229  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  36.06 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  38.87 
 
 		 330 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  37.96 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  37.32 
 
 		 327 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  37.32 
 
 		 327 aa  222  9e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  37.71 
 
 		 328 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  38.3 
 
 		 325 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  39.07 
 
 		 324 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  37.18 
 
 		 331 aa  213  5.999999999999999e-54  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  35.67 
 
 		 328 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  36.23 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  35.65 
 
 		 328 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  35.65 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  35.65 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  35.65 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  35.65 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  35.65 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  35.65 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  35.36 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  35.36 
 
 		 328 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  35.36 
 
 		 362 aa  202  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  35.36 
 
 		 337 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  35.36 
 
 		 337 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  35.36 
 
 		 337 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  35.87 
 
 		 328 aa  192  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  37.82 
 
 		 323 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  37.69 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  35.41 
 
 		 333 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  32.88 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  50.59 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  43 
 
 		 340 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  33.63 
 
 		 323 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  33.74 
 
 		 325 aa  163  3e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  31.74 
 
 		 331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  31.49 
 
 		 323 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.24 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  32.47 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  28.13 
 
 		 395 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  36.87 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  31.86 
 
 		 323 aa  159  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  33.91 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  29.07 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  34.13 
 
 		 324 aa  153  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  59.02 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  53.28 
 
 		 324 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  28.82 
 
 		 358 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  44.37 
 
 		 190 aa  133  3.9999999999999996e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  37.7 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  35.79 
 
 		 349 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  33.02 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.81 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.81 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  32.24 
 
 		 357 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.97 
 
 		 386 aa  106  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  35.18 
 
 		 369 aa  106  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  34.5 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  34.04 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  33.5 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  37.04 
 
 		 341 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.23 
 
 		 349 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  34.83 
 
 		 375 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  36.02 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 324 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  27.15 
 
 		 308 aa  104  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  32.98 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.75 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.75 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.75 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.75 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.75 
 
 		 357 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  33.7 
 
 		 366 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.75 
 
 		 357 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  32.4 
 
 		 362 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  34.75 
 
 		 390 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.37 
 
 		 323 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 327 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>