More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1054 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  673    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  42.26 
 
 
329 aa  244  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  39.05 
 
 
328 aa  231  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.77 
 
 
356 aa  228  1e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  40.06 
 
 
350 aa  225  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  38.41 
 
 
328 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  36.76 
 
 
351 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  39.81 
 
 
328 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  39.42 
 
 
330 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  39.74 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  37.88 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  38.17 
 
 
327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  37.9 
 
 
336 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  37.18 
 
 
357 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  37.93 
 
 
327 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  37.93 
 
 
327 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  38.41 
 
 
328 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  39.16 
 
 
324 aa  208  1e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  40.57 
 
 
333 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  36.56 
 
 
351 aa  205  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  38.78 
 
 
347 aa  205  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.8 
 
 
346 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.91 
 
 
365 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  35.41 
 
 
378 aa  200  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  37.99 
 
 
362 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  37.99 
 
 
337 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  37.99 
 
 
337 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  37.99 
 
 
328 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  38.11 
 
 
337 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  37.42 
 
 
328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  35.89 
 
 
372 aa  197  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  35.89 
 
 
367 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  36.16 
 
 
340 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  37.1 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  38.75 
 
 
325 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  37.1 
 
 
328 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  37.1 
 
 
328 aa  196  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  37.1 
 
 
328 aa  196  6e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  37.1 
 
 
328 aa  196  6e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  37.1 
 
 
328 aa  196  6e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  37.1 
 
 
328 aa  196  6e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  35.81 
 
 
370 aa  194  1e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  34.51 
 
 
368 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  32.78 
 
 
362 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  34.24 
 
 
368 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 
375 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  34.51 
 
 
368 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  37.1 
 
 
328 aa  193  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  37.08 
 
 
334 aa  192  5e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  38.51 
 
 
331 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  34.07 
 
 
360 aa  188  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  35.74 
 
 
340 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  36.36 
 
 
328 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  31.71 
 
 
395 aa  175  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  36.3 
 
 
351 aa  175  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  34.13 
 
 
323 aa  169  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  34.22 
 
 
364 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  34.13 
 
 
323 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  33.13 
 
 
323 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.21 
 
 
323 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  30.06 
 
 
369 aa  159  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  37.84 
 
 
322 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  33.53 
 
 
323 aa  155  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  32.84 
 
 
323 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  32.93 
 
 
323 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  36.51 
 
 
324 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  35.22 
 
 
324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  29.38 
 
 
358 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  30.09 
 
 
325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  35.25 
 
 
322 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  37.06 
 
 
190 aa  128  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  30.65 
 
 
378 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  36.57 
 
 
313 aa  117  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  33.73 
 
 
322 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  35.51 
 
 
341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  32.87 
 
 
349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  28.37 
 
 
336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  34.87 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  29.52 
 
 
364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  38 
 
 
337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.94 
 
 
344 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.62 
 
 
327 aa  110  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05461  G3E family GTPase  35.11 
 
 
383 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.412764  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  37.11 
 
 
333 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  37.02 
 
 
338 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  34.2 
 
 
380 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05171  G3E family GTPase  35.11 
 
 
362 aa  108  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.842312  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  32.99 
 
 
382 aa  107  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  34.71 
 
 
388 aa  107  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  34.43 
 
 
362 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  33.88 
 
 
357 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  33.51 
 
 
373 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.05 
 
 
344 aa  107  4e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.1 
 
 
349 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.03 
 
 
323 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  34.36 
 
 
379 aa  106  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  36.46 
 
 
322 aa  106  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.11 
 
 
358 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.11 
 
 
355 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.11 
 
 
355 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>