More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1874 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 325 aa  663    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  33.99 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  34.41 
 
 		 333 aa  176  5e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  31.66 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  33.74 
 
 		 357 aa  163  3e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  30.43 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  33.01 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.09 
 
 		 356 aa  152  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  29.75 
 
 		 328 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  32.3 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  30.09 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  32.39 
 
 		 360 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  33.02 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  33.02 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  33.02 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  33.02 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  33.02 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  33.02 
 
 		 328 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  31.31 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  33.12 
 
 		 328 aa  146  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  33.02 
 
 		 328 aa  146  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  32.52 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  29.82 
 
 		 325 aa  145  8.000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  32.52 
 
 		 327 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  32.7 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  31.72 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  32.22 
 
 		 327 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  31.42 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  32.09 
 
 		 368 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  31.89 
 
 		 324 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  31.62 
 
 		 375 aa  142  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  32.36 
 
 		 368 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.53 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  30.97 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  32.39 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  32.39 
 
 		 337 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  29.36 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  32.6 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  31.16 
 
 		 364 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  30.99 
 
 		 362 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  29.84 
 
 		 328 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  32.29 
 
 		 328 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  31.56 
 
 		 328 aa  139  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.99 
 
 		 365 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  28.8 
 
 		 330 aa  136  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  29.5 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  29.18 
 
 		 372 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  29.46 
 
 		 367 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  31.92 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  31.79 
 
 		 336 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  29.3 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  31.61 
 
 		 323 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  30.36 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  29.69 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  32.4 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  26.54 
 
 		 378 aa  130  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  30.46 
 
 		 370 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  31.07 
 
 		 350 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  30.5 
 
 		 323 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  31.31 
 
 		 324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  31.4 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  29.36 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  27.68 
 
 		 378 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  29.55 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  29.85 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  37.7 
 
 		 347 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  26.02 
 
 		 369 aa  122  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  27.68 
 
 		 362 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  29.38 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  32.48 
 
 		 324 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  27.74 
 
 		 341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  29.07 
 
 		 349 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15320  cobalamin synthesis protein P47K  26.69 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  34.12 
 
 		 190 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  31.67 
 
 		 369 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  27.74 
 
 		 327 aa  99.4  9e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.12 
 
 		 323 aa  97.4  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  26.5 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  34.68 
 
 		 313 aa  96.7  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  31.89 
 
 		 353 aa  96.3  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.16 
 
 		 353 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  31.58 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  32.16 
 
 		 349 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  32.99 
 
 		 394 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.94 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  32.75 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0865  cobalamin synthesis protein P47K  31.95 
 
 		 346 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0891  cobalamin synthesis protein P47K  31.95 
 
 		 346 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.441497  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  32.94 
 
 		 343 aa  94.7  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  26.52 
 
 		 365 aa  94  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  32.35 
 
 		 393 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  30.86 
 
 		 344 aa  93.2  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  30.95 
 
 		 362 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  28.66 
 
 		 333 aa  92.4  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  30.99 
 
 		 324 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  29.47 
 
 		 325 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0536  cobalamin synthesis protein, P47K  26.25 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>