More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3241 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 324 aa  665    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  73.99 
 
 		 327 aa  503  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  73.99 
 
 		 327 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  73.99 
 
 		 327 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  68.83 
 
 		 328 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  68.52 
 
 		 328 aa  465  9.999999999999999e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  69.85 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  69.85 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  69.85 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  69.85 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  69.85 
 
 		 328 aa  457  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  69.85 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  69.85 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  69.85 
 
 		 328 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  68.21 
 
 		 324 aa  454  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  69.54 
 
 		 328 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  67.08 
 
 		 362 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  67.08 
 
 		 337 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  67.38 
 
 		 337 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  67.08 
 
 		 328 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  67.08 
 
 		 337 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  67.28 
 
 		 325 aa  428  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  66.15 
 
 		 328 aa  418  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  42.19 
 
 		 328 aa  272  7e-72  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  42.46 
 
 		 329 aa  270  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  43.3 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  43.57 
 
 		 328 aa  269  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.11 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  40.73 
 
 		 340 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  41.16 
 
 		 351 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  42.28 
 
 		 336 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  41.36 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.07 
 
 		 346 aa  237  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  45.31 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  43.63 
 
 		 350 aa  229  5e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  38.82 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  40.33 
 
 		 378 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.66 
 
 		 365 aa  226  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  38.7 
 
 		 360 aa  227  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  38.04 
 
 		 375 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  43.39 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  38.59 
 
 		 368 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  38.04 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  38.04 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  41.41 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  38.55 
 
 		 372 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  38.55 
 
 		 367 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  39.74 
 
 		 331 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  42.12 
 
 		 334 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  39.55 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  37.92 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  37.5 
 
 		 357 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  35.94 
 
 		 351 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  38.77 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  38.76 
 
 		 331 aa  175  8e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  37.65 
 
 		 322 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  34.44 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  36.06 
 
 		 323 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  35.49 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  34.14 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  37.46 
 
 		 324 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  36.55 
 
 		 323 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  37.17 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  34.74 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  34.06 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  30.08 
 
 		 395 aa  155  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  36.67 
 
 		 324 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  32.3 
 
 		 325 aa  149  8e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  27.91 
 
 		 369 aa  142  5e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  39.15 
 
 		 190 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  27.97 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  29.23 
 
 		 378 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  32.41 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  32.07 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  33.04 
 
 		 324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  36.97 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  36.36 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  31.11 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  31.73 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  33.85 
 
 		 354 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  32.62 
 
 		 369 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  32.39 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  34.57 
 
 		 349 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  34.71 
 
 		 360 aa  104  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 		 333 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  34.55 
 
 		 367 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  27.54 
 
 		 323 aa  103  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  34.55 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  38.27 
 
 		 384 aa  102  6e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  32.1 
 
 		 308 aa  102  8e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.94 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  29.72 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  29.72 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  31.48 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.78 
 
 		 334 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  32.84 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  30.84 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  36.14 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  31.33 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>