More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0670 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  100 
 
 		 330 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  64.17 
 
 		 328 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  66.56 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  59.63 
 
 		 329 aa  402  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  43.17 
 
 		 327 aa  286  5e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  44.13 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  44.24 
 
 		 324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  43.17 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  43.17 
 
 		 327 aa  282  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  44.76 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  44.44 
 
 		 328 aa  276  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  44.2 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  44.2 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  44.2 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  44.2 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  44.2 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  44.2 
 
 		 328 aa  275  5e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  44.2 
 
 		 328 aa  275  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  43.89 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  43.81 
 
 		 325 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  43.89 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  43.26 
 
 		 337 aa  273  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  43.26 
 
 		 337 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  43.26 
 
 		 337 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  43.26 
 
 		 328 aa  272  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  43.26 
 
 		 362 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  43.81 
 
 		 336 aa  265  8e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  44.1 
 
 		 328 aa  265  8.999999999999999e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  42.74 
 
 		 351 aa  263  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  44.13 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.73 
 
 		 356 aa  254  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  40.59 
 
 		 372 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.32 
 
 		 365 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  40.55 
 
 		 367 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  41.99 
 
 		 370 aa  252  7e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  41.4 
 
 		 346 aa  250  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  40.44 
 
 		 375 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  40.98 
 
 		 368 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  39.78 
 
 		 360 aa  248  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  40.98 
 
 		 368 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  40.71 
 
 		 368 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  39.41 
 
 		 378 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  40.62 
 
 		 340 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  38.98 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  42.17 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  40.79 
 
 		 333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  38.01 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  38.04 
 
 		 357 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  39.74 
 
 		 331 aa  222  8e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  35.24 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  37.09 
 
 		 364 aa  209  4e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  36.3 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  39.22 
 
 		 331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  36.29 
 
 		 351 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  48.77 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  30.48 
 
 		 323 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  33.02 
 
 		 322 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  31.8 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  33.94 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  31.01 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.13 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  32.93 
 
 		 323 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  31.66 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  30.69 
 
 		 323 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  37.5 
 
 		 395 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  28.34 
 
 		 325 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  30.94 
 
 		 358 aa  137  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  32.69 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  47.14 
 
 		 190 aa  135  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  29.97 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  32.87 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  34.3 
 
 		 369 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  32.57 
 
 		 327 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  38.12 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  38.31 
 
 		 333 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  40 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  29.5 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  29.5 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  28.97 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 		 384 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  33.74 
 
 		 348 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 360 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  36.08 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  31.18 
 
 		 343 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 		 324 aa  99.4  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  30.8 
 
 		 320 aa  99  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  30.36 
 
 		 335 aa  99  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1753  cobalamin synthesis protein, P47K  36.54 
 
 		 344 aa  98.6  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2644  cobalamin synthesis protein P47K  31.79 
 
 		 373 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.341844 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0441  cobalamin synthesis protein, P47K  36.97 
 
 		 382 aa  98.6  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.319844  normal  0.988623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  29.2 
 
 		 326 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  35.58 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  36.59 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  30.26 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  35.62 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 345 aa  97.4  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  32.73 
 
 		 360 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  32.74 
 
 		 365 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.57 
 
 		 344 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  32.52 
 
 		 369 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>