More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_5072 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  100 
 
 		 323 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  84.21 
 
 		 323 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  67.39 
 
 		 323 aa  422  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  60.44 
 
 		 323 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  59.5 
 
 		 324 aa  365  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  59.2 
 
 		 323 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  58.28 
 
 		 323 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  59.5 
 
 		 323 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  62.11 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  53.09 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  54.63 
 
 		 322 aa  296  3e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  34.58 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  34.37 
 
 		 336 aa  175  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  32.46 
 
 		 351 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  33.63 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  33.54 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  33.15 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  37.14 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  31.99 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  32.5 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  34.44 
 
 		 324 aa  164  2.0000000000000002e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  35.63 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.4 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  34.81 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  31.72 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  31.72 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  30.91 
 
 		 368 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  33.04 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  35.33 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  35.33 
 
 		 327 aa  159  5e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  32.42 
 
 		 356 aa  159  7e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  32.01 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  29.78 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  33.53 
 
 		 331 aa  155  6e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  30.6 
 
 		 362 aa  156  6e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  33.33 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  33.95 
 
 		 333 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  30.88 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  45.29 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  55.04 
 
 		 346 aa  151  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  30 
 
 		 330 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  32.47 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  51.49 
 
 		 378 aa  149  5e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  34.55 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  34.55 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  33.23 
 
 		 324 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  32.72 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  34.55 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  34.55 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  34.55 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  34.55 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  34.55 
 
 		 328 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  34.55 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  34.55 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  33.13 
 
 		 337 aa  146  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  53.79 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  32.83 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  32.83 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  32.83 
 
 		 337 aa  145  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  32.15 
 
 		 328 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  45.86 
 
 		 372 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  45.86 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  31.1 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  31.69 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  33.89 
 
 		 347 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  44.79 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  33.02 
 
 		 331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  32.4 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  41.22 
 
 		 190 aa  122  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  25.77 
 
 		 358 aa  122  8e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  39.16 
 
 		 378 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  33.92 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  26.16 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  25.83 
 
 		 308 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.65 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  29.65 
 
 		 307 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.15 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.15 
 
 		 307 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000478714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.15 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.64 
 
 		 307 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  36.3 
 
 		 333 aa  94.7  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  29.15 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  29.15 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.64 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000823465 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  29.15 
 
 		 307 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  36.84 
 
 		 313 aa  93.2  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  27.14 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.55 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.21 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2083  cobalamin synthesis protein P47K  38.18 
 
 		 311 aa  90.5  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.083483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  33.16 
 
 		 345 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  32.98 
 
 		 343 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06660  predicted GTPase, G3E family  37.02 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.747392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  32.78 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  33.33 
 
 		 322 aa  88.2  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0228  cobalamin synthesis protein/P47K  28.79 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.91 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  33.12 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  28.8 
 
 		 320 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  29.18 
 
 		 349 aa  86.7  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>