More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3001 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3001  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 		 378 aa  771    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.696763  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3334  cobalamin synthesis protein, P47K  55.03 
 
 		 351 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00186258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3483  cobalamin synthesis protein P47K  53.3 
 
 		 351 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.073261 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1255  cobalamin synthesis protein, P47K  51.03 
 
 		 360 aa  381  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1328  cobalamin synthesis protein P47K  51.8 
 
 		 368 aa  378  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3020  cobalamin synthesis protein P47K  51.55 
 
 		 368 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1338  cobalamin synthesis protein P47K  51.16 
 
 		 375 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1364  cobalamin synthesis protein P47K  51.8 
 
 		 368 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.99457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2751  cobalamin synthesis protein, P47K  50.13 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2829  cobalamin synthesis protein, P47K  50.13 
 
 		 367 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2927  cobalamin synthesis protein, P47K  49.1 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1502  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  49.22 
 
 		 365 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2776  cobalamin synthesis protein, P47K  48.95 
 
 		 357 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2446  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  44.3 
 
 		 346 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2575  cobalamin synthesis protein, P47K  44.47 
 
 		 364 aa  298  1e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2795  cobalamin synthesis protein, P47K  42.42 
 
 		 362 aa  293  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1975  putative GTPase  43.34 
 
 		 336 aa  273  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1300  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  42.34 
 
 		 356 aa  273  5.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2908  cobalamin synthesis protein, P47K  40.53 
 
 		 340 aa  265  8e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.127945  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0670  putative cobalamin synthesis protein  39.41 
 
 		 330 aa  245  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.486225  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05440  putative GTPase  37.67 
 
 		 328 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1919  cobalamin synthesis protein P47K  39.3 
 
 		 328 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.295788  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06411  hypothetical protein  63.01 
 
 		 334 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0460  hypothetical protein  37.87 
 
 		 329 aa  232  7.000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.27169  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1648  cobalamin synthesis protein P47K  39.78 
 
 		 328 aa  229  6e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.11533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1503  CobW/P47K family protein  39.68 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2782  cobalamin synthesis protein P47K  39.95 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2705  CobW/P47K family protein  39.95 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3241  cobalamin synthesis protein P47K  40.33 
 
 		 324 aa  227  3e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520466 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2430  cobalamin synthesis protein P47K  39.68 
 
 		 325 aa  224  3e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2333  cobalamin synthesis protein P47K  38.52 
 
 		 324 aa  216  5e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02103  predicted enzyme  37.33 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0785  CobW/P47K family protein  37.33 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.145  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2471  CobW/P47K family protein  37.33 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.046974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1474  cobalamin synthesis protein P47K  37.33 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00100223  hitchhiker  0.00332333 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2311  CobW/P47K family protein  37.33 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.203993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02062  hypothetical protein  37.33 
 
 		 328 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1484  cobalamin synthesis protein P47K  37.06 
 
 		 328 aa  210  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.176394  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2361  cobalamin synthesis protein, P47K  38.38 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000667582  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2406  cobalamin synthesis protein P47K  38.38 
 
 		 337 aa  210  3e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000018505 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2452  cobalamin synthesis protein, P47K  38.38 
 
 		 337 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00835886  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2563  cobalamin synthesis protein, P47K  38.69 
 
 		 328 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00261863  decreased coverage  0.00000585707 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2449  cobalamin synthesis protein, P47K  38.38 
 
 		 362 aa  209  5e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.566188  decreased coverage  0.0000000416664 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2162  cobalamin synthesis protein, P47K  39.05 
 
 		 331 aa  209  8e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.608946  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2322  CobW/P47K family protein  37.06 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.366233  hitchhiker  0.00913363 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3311  CobW/P47K family protein  37.06 
 
 		 328 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.045783 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1054  hypothetical protein  35.41 
 
 		 331 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0683  cobalamin synthesis protein P47K  36.53 
 
 		 350 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.609439  normal  0.0145183 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2593  cobalamin synthesis protein, P47K  34.93 
 
 		 347 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.404806  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001505  Putative GTPase (G3E family)  53.33 
 
 		 328 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000327168  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1815  cobalamin synthesis protein, P47K  33.06 
 
 		 333 aa  182  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0134  cobalamin synthesis protein, P47K  31.98 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5137  cobalamin synthesis protein P47K  32.89 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.36371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2769  cobalamin synthesis protein, P47K  53.55 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.516201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1570  cobalamin synthesis protein P47K  45.45 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000217746 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72980  G3E family GTPase  33.42 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0091957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1737  cobalamin synthesis protein, P47K  31.34 
 
 		 351 aa  166  5.9999999999999996e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00683166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01740  hypothetical protein  34.23 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0125  hypothetical protein  29.44 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0228  cobalamin synthesis protein, P47K  30.36 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5652  cobalamin synthesis protein/P47K  51.45 
 
 		 323 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5523  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  54.2 
 
 		 323 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5072  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  51.49 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4533  cobalamin synthesis protein, P47K  55.93 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6334  cobalamin synthesis protein/P47K  51.59 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5359  CobW/P47K family protein  50.75 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3651  cobalamin synthesis protein, P47K  43.42 
 
 		 190 aa  137  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5408  cobalamin synthesis protein P47K  51.15 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569577 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0456  cobalamin synthesis protein/P47K  26.58 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.576952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5267  cobalamin synthesis protein, P47K  50 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363719 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1874  cobalamin synthesis protein/P47K  27.68 
 
 		 325 aa  126  5e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0046  cobalamin synthesis protein P47K  34.17 
 
 		 345 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000730504  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14784  predicted protein  34.43 
 
 		 378 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.101479 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0338  cobalamin synthesis protein P47K  36.87 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  34.62 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.57 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.57 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  37.31 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  31.94 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2883  cobalamin synthesis protein P47K  33.33 
 
 		 360 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00106206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  31.58 
 
 		 349 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0042  CobW/P47K family protein  29.63 
 
 		 308 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  35.32 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0043  CobW/P47K family protein  29.17 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.845125  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  34.21 
 
 		 313 aa  103  6e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  30.53 
 
 		 325 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  36.31 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.67 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.96 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  28.96 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  33.33 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  35.16 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  32.64 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  30.99 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.2 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0321  cobalamin synthesis protein P47K  34.55 
 
 		 364 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.276547 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.17 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0491  hypothetical protein  31.25 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0830931  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  35.38 
 
 		 369 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>