More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1307 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  100 
 
 
349 aa  703    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  95.98 
 
 
349 aa  676    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  99.71 
 
 
349 aa  700    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  73.7 
 
 
349 aa  530  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  72.25 
 
 
349 aa  522  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  75.36 
 
 
354 aa  518  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  68.3 
 
 
357 aa  455  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  57.57 
 
 
345 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.43 
 
 
359 aa  385  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.23 
 
 
344 aa  376  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.26 
 
 
348 aa  373  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.69 
 
 
349 aa  370  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.14 
 
 
344 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.56 
 
 
344 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.44 
 
 
344 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  57.31 
 
 
350 aa  361  9e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  57.48 
 
 
344 aa  360  3e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.39 
 
 
348 aa  353  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  53.98 
 
 
344 aa  352  7e-96  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.9 
 
 
344 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.54 
 
 
386 aa  349  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.51 
 
 
344 aa  349  5e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  52.2 
 
 
343 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.55 
 
 
344 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.44 
 
 
357 aa  339  5e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.71 
 
 
355 aa  338  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.12 
 
 
358 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  53.74 
 
 
375 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.15 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.15 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.02 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.15 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.15 
 
 
357 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.13 
 
 
355 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.15 
 
 
390 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  54.14 
 
 
350 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.43 
 
 
355 aa  335  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.15 
 
 
357 aa  335  5e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  48.57 
 
 
348 aa  333  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.98 
 
 
363 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  52.26 
 
 
367 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  52.34 
 
 
354 aa  331  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  52.85 
 
 
354 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  53.27 
 
 
357 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.3 
 
 
350 aa  328  8e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.52 
 
 
348 aa  325  6e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  53.92 
 
 
350 aa  324  2e-87  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.7 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  51.37 
 
 
335 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.24 
 
 
349 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.76 
 
 
334 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.06 
 
 
345 aa  315  7e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.68 
 
 
358 aa  315  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.18 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  51.76 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.19 
 
 
360 aa  308  5.9999999999999995e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  49.13 
 
 
335 aa  308  9e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  49.72 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.72 
 
 
362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.35 
 
 
344 aa  306  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.72 
 
 
362 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.44 
 
 
362 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  49.16 
 
 
362 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.42 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.72 
 
 
362 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  49.71 
 
 
346 aa  299  4e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.43 
 
 
369 aa  299  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.35 
 
 
343 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  47.45 
 
 
343 aa  292  7e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  43.63 
 
 
369 aa  279  4e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  39.32 
 
 
344 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  40.23 
 
 
371 aa  259  4e-68  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  39.09 
 
 
351 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  40.24 
 
 
381 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  37.8 
 
 
364 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  34.2 
 
 
354 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  34.2 
 
 
354 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  33.62 
 
 
354 aa  229  8e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  34.12 
 
 
350 aa  216  7e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.95 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  33.81 
 
 
323 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  32.66 
 
 
323 aa  175  9e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  31.61 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  31.61 
 
 
323 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.95 
 
 
323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  35.95 
 
 
320 aa  170  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.46 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  33.52 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.79 
 
 
337 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35 
 
 
346 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  32.8 
 
 
375 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  35.52 
 
 
332 aa  162  6e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.41 
 
 
320 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  30.57 
 
 
319 aa  159  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  34.12 
 
 
326 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  31.52 
 
 
336 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 
328 aa  157  3e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.38 
 
 
328 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  32.73 
 
 
349 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  32.79 
 
 
369 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>