More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1617 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  100 
 
 		 625 aa  1268    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  52.95 
 
 		 648 aa  618  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  34.68 
 
 		 640 aa  329  7e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  30.87 
 
 		 596 aa  268  2e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  32.81 
 
 		 624 aa  250  5e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  29.65 
 
 		 614 aa  231  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1723  cobalamin synthesis protein P47K  28.46 
 
 		 615 aa  190  9e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  31.65 
 
 		 308 aa  159  1e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1230  cobalamin synthesis protein, P47K  30.99 
 
 		 340 aa  126  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.312902 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  29.9 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  31.33 
 
 		 332 aa  125  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  32.79 
 
 		 320 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  31.17 
 
 		 323 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2074  cobalamin synthesis protein P47K  31.08 
 
 		 349 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0490287  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  39.5 
 
 		 393 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  40.61 
 
 		 354 aa  121  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  26.99 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1338  cobalamin synthesis protein, P47K  36.64 
 
 		 407 aa  119  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39 
 
 		 374 aa  119  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2183  hypothetical protein  36.4 
 
 		 404 aa  119  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.233817  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  31.5 
 
 		 324 aa  118  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  27.47 
 
 		 404 aa  118  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  30.85 
 
 		 349 aa  118  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0344  cobalamin synthesis/P47K family protein  27.72 
 
 		 308 aa  118  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  38.5 
 
 		 343 aa  118  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.8 
 
 		 327 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  28.31 
 
 		 394 aa  117  6.9999999999999995e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4200  cobalamin synthesis protein P47K  30.94 
 
 		 336 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000951795  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  36.16 
 
 		 327 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  29.15 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  34.27 
 
 		 367 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  36.73 
 
 		 369 aa  114  5e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5244  hypothetical protein  28.78 
 
 		 334 aa  114  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536165  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  28.53 
 
 		 342 aa  114  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  35.1 
 
 		 360 aa  114  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  31.54 
 
 		 328 aa  114  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  29.91 
 
 		 323 aa  113  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2592  putative 47 kDa protein  34.06 
 
 		 403 aa  113  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00869737 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  34.38 
 
 		 353 aa  113  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0581  cobalamin synthesis protein P47K  29.25 
 
 		 394 aa  113  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  29.56 
 
 		 323 aa  113  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  27.54 
 
 		 344 aa  113  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5758  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  30.82 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4067  cobalamin synthesis protein, P47K  36.75 
 
 		 403 aa  113  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  36.46 
 
 		 493 aa  113  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  36.61 
 
 		 349 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4060  hypothetical protein  38.65 
 
 		 395 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  27.62 
 
 		 319 aa  112  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3502  cobalamin synthesis protein, P47K  33.48 
 
 		 410 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.461262 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  32.32 
 
 		 320 aa  112  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4174  cobalamin synthesis protein P47K  33.63 
 
 		 401 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0080  cobalamin synthesis protein, putative  29.55 
 
 		 400 aa  111  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  28.01 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.76 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.44 
 
 		 316 aa  110  5e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  31.56 
 
 		 320 aa  110  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.44 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2385  cobalamin synthesis protein P47K  36.07 
 
 		 401 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  36.08 
 
 		 365 aa  110  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1231  cobalamin synthesis protein, P47K  28.76 
 
 		 406 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.201771 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05541  G3E family GTPase  36.31 
 
 		 357 aa  110  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.427683  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  28.14 
 
 		 362 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  30.3 
 
 		 324 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  26.82 
 
 		 310 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.44 
 
 		 319 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0029  cobalamin synthesis protein P47K  29.41 
 
 		 364 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  28.66 
 
 		 349 aa  110  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.44 
 
 		 316 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  31.9 
 
 		 325 aa  110  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  30.3 
 
 		 326 aa  110  9.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  29.24 
 
 		 347 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  36.46 
 
 		 350 aa  109  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  34.97 
 
 		 323 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  32.11 
 
 		 379 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4357  cobalamin synthesis protein, P47K  31.29 
 
 		 419 aa  110  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2254  cobalamin synthesis protein, P47K  33.62 
 
 		 403 aa  109  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  36.46 
 
 		 361 aa  110  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07121  G3E family GTPase  27.78 
 
 		 366 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0080  cobalamin synthesis protein, P47K  32.89 
 
 		 404 aa  110  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.44 
 
 		 316 aa  109  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1120  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.07 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.201392  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1025  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  34.07 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4936  cobalamin synthesis protein P47K  35.32 
 
 		 402 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.753815 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  27.44 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  27.44 
 
 		 316 aa  109  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0064  cobalamin synthesis protein P47K  34.82 
 
 		 436 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  32.11 
 
 		 372 aa  109  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1980  hypothetical protein  29.49 
 
 		 402 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0097799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  34.57 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  33.85 
 
 		 355 aa  109  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0006  cobalamin synthesis protein, P47K  34.38 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273813  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3034  cobalamin synthesis protein, P47K  35.32 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0820283  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0054  cobalamin synthesis protein, P47K  34.82 
 
 		 436 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6213  cobalamin synthesis protein P47K  34.65 
 
 		 403 aa  109  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575624  normal  0.0528203 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5332  cobalamin synthesis protein, P47K  35.32 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  27.13 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0193  cobalamin synthesis protein P47K  31.01 
 
 		 320 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.9456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4881  cobalamin synthesis protein/P47K  28.7 
 
 		 323 aa  108  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7626  cobalamin synthesis protein/P47K  31.91 
 
 		 345 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.347938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>